Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Subh2bvQ9D9Z7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms