Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zcchc8Q9CYA6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms