Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol9aQ8VDU3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 265.7 ms