Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrrdQ8K2M3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrdQ8K2M3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms