Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms