Protein–RNA interactions for Protein: Q3UST5

UPF0764 protein C16orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UST5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3UST5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3UST5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3UST5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3UST5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3UST5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3UST5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3UST5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3UST5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3UST5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3UST5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3UST5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3UST5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3UST5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3UST5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3UST5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3UST5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3UST5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3UST5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3UST5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UST5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UST5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UST5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UST5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UST5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UST5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UST5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UST5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UST5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UST5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UST5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UST5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UST5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UST5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UST5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UST5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UST5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UST5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UST5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UST5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UST5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UST5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UST5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UST5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UST5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UST5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3UST5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3UST5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3UST5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Q3UST5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3UST5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Q3UST5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3UST5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3UST5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q3UST5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3UST5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q3UST5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q3UST5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q3UST5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3UST5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q3UST5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3UST5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3UST5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q3UST5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3UST5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3UST5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3UST5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UST5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UST5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UST5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UST5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UST5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UST5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UST5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UST5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UST5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UST5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UST5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UST5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3UST5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3UST5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3UST5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3UST5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3UST5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3UST5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3UST5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3UST5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3UST5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3UST5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3UST5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3UST5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3UST5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3UST5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3UST5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3UST5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3UST5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3UST5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3UST5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3UST5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3UST5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms