Protein–RNA interactions for Protein: Q3U435

Mmp25, Matrix metalloproteinase-25, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp25Q3U435 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp25Q3U435 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms