Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms