Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prf1P10820 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prf1P10820 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prf1P10820 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prf1P10820 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prf1P10820 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prf1P10820 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms