Protein–RNA interactions for Protein: O88447

Klc1, Kinesin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc1O88447 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klc1O88447 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klc1O88447 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klc1O88447 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klc1O88447 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klc1O88447 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klc1O88447 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klc1O88447 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klc1O88447 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klc1O88447 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klc1O88447 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klc1O88447 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klc1O88447 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klc1O88447 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klc1O88447 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klc1O88447 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klc1O88447 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klc1O88447 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klc1O88447 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc1O88447 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms