Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna3O08545 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna3O08545 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna3O08545 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna3O08545 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna3O08545 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms