Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC11□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC11□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC11□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms