Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vmn2r25W4VSP2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vmn2r25W4VSP2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vmn2r25W4VSP2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Vmn2r25W4VSP2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vmn2r25W4VSP2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vmn2r25W4VSP2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vmn2r25W4VSP2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vmn2r25W4VSP2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vmn2r25W4VSP2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vmn2r25W4VSP2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vmn2r25W4VSP2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vmn2r25W4VSP2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn2r25W4VSP2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn2r25W4VSP2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn2r25W4VSP2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn2r25W4VSP2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn2r25W4VSP2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn2r25W4VSP2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn2r25W4VSP2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn2r25W4VSP2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn2r25W4VSP2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vmn2r25W4VSP2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vmn2r25W4VSP2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn2r25W4VSP2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn2r25W4VSP2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn2r25W4VSP2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn2r25W4VSP2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn2r25W4VSP2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn2r25W4VSP2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn2r25W4VSP2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn2r25W4VSP2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn2r25W4VSP2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn2r25W4VSP2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn2r25W4VSP2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn2r25W4VSP2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn2r25W4VSP2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn2r25W4VSP2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn2r25W4VSP2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vmn2r25W4VSP2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vmn2r25W4VSP2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn2r25W4VSP2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn2r25W4VSP2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn2r25W4VSP2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vmn2r25W4VSP2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vmn2r25W4VSP2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn2r25W4VSP2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn2r25W4VSP2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn2r25W4VSP2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn2r25W4VSP2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vmn2r25W4VSP2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn2r25W4VSP2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn2r25W4VSP2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn2r25W4VSP2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn2r25W4VSP2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn2r25W4VSP2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn2r25W4VSP2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn2r25W4VSP2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn2r25W4VSP2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn2r25W4VSP2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn2r25W4VSP2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn2r25W4VSP2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn2r25W4VSP2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn2r25W4VSP2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn2r25W4VSP2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn2r25W4VSP2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn2r25W4VSP2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn2r25W4VSP2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn2r25W4VSP2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn2r25W4VSP2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn2r25W4VSP2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn2r25W4VSP2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn2r25W4VSP2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn2r25W4VSP2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn2r25W4VSP2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn2r25W4VSP2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn2r25W4VSP2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn2r25W4VSP2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn2r25W4VSP2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vmn2r25W4VSP2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Vmn2r25W4VSP2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vmn2r25W4VSP2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn2r25W4VSP2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn2r25W4VSP2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn2r25W4VSP2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn2r25W4VSP2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vmn2r25W4VSP2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vmn2r25W4VSP2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn2r25W4VSP2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn2r25W4VSP2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn2r25W4VSP2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn2r25W4VSP2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vmn2r25W4VSP2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vmn2r25W4VSP2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vmn2r25W4VSP2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vmn2r25W4VSP2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vmn2r25W4VSP2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn2r25W4VSP2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vmn2r25W4VSP2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vmn2r25W4VSP2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms