Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3550W4VSN7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3550W4VSN7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3550W4VSN7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3550W4VSN7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3550W4VSN7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3550W4VSN7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3550W4VSN7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3550W4VSN7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3550W4VSN7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3550W4VSN7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3550W4VSN7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3550W4VSN7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3550W4VSN7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3550W4VSN7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3550W4VSN7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3550W4VSN7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3550W4VSN7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3550W4VSN7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3550W4VSN7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3550W4VSN7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3550W4VSN7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3550W4VSN7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3550W4VSN7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3550W4VSN7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3550W4VSN7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3550W4VSN7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3550W4VSN7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3550W4VSN7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3550W4VSN7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3550W4VSN7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3550W4VSN7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3550W4VSN7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3550W4VSN7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3550W4VSN7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3550W4VSN7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3550W4VSN7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3550W4VSN7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3550W4VSN7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3550W4VSN7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3550W4VSN7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3550W4VSN7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3550W4VSN7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3550W4VSN7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3550W4VSN7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3550W4VSN7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3550W4VSN7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3550W4VSN7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm3550W4VSN7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm3550W4VSN7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3550W4VSN7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3550W4VSN7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3550W4VSN7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3550W4VSN7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3550W4VSN7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3550W4VSN7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3550W4VSN7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3550W4VSN7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3550W4VSN7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3550W4VSN7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3550W4VSN7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3550W4VSN7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3550W4VSN7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3550W4VSN7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3550W4VSN7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3550W4VSN7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3550W4VSN7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3550W4VSN7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3550W4VSN7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3550W4VSN7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3550W4VSN7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3550W4VSN7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3550W4VSN7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3550W4VSN7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3550W4VSN7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3550W4VSN7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3550W4VSN7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3550W4VSN7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3550W4VSN7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3550W4VSN7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3550W4VSN7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3550W4VSN7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3550W4VSN7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3550W4VSN7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3550W4VSN7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3550W4VSN7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3550W4VSN7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3550W4VSN7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3550W4VSN7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3550W4VSN7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3550W4VSN7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3550W4VSN7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3550W4VSN7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3550W4VSN7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3550W4VSN7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3550W4VSN7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3550W4VSN7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3550W4VSN7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3550W4VSN7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3550W4VSN7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms