Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vstm4T1NXB5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vstm4T1NXB5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vstm4T1NXB5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vstm4T1NXB5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vstm4T1NXB5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vstm4T1NXB5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vstm4T1NXB5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vstm4T1NXB5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vstm4T1NXB5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vstm4T1NXB5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Vstm4T1NXB5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Vstm4T1NXB5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Vstm4T1NXB5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Vstm4T1NXB5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vstm4T1NXB5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vstm4T1NXB5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vstm4T1NXB5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vstm4T1NXB5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vstm4T1NXB5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vstm4T1NXB5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Vstm4T1NXB5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vstm4T1NXB5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vstm4T1NXB5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vstm4T1NXB5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vstm4T1NXB5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Vstm4T1NXB5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vstm4T1NXB5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vstm4T1NXB5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vstm4T1NXB5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vstm4T1NXB5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vstm4T1NXB5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vstm4T1NXB5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vstm4T1NXB5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vstm4T1NXB5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vstm4T1NXB5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vstm4T1NXB5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vstm4T1NXB5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vstm4T1NXB5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vstm4T1NXB5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vstm4T1NXB5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vstm4T1NXB5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vstm4T1NXB5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vstm4T1NXB5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vstm4T1NXB5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vstm4T1NXB5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vstm4T1NXB5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vstm4T1NXB5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vstm4T1NXB5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vstm4T1NXB5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Vstm4T1NXB5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Vstm4T1NXB5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vstm4T1NXB5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vstm4T1NXB5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vstm4T1NXB5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vstm4T1NXB5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vstm4T1NXB5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vstm4T1NXB5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vstm4T1NXB5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vstm4T1NXB5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vstm4T1NXB5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vstm4T1NXB5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vstm4T1NXB5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vstm4T1NXB5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vstm4T1NXB5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vstm4T1NXB5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vstm4T1NXB5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vstm4T1NXB5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vstm4T1NXB5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vstm4T1NXB5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vstm4T1NXB5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vstm4T1NXB5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vstm4T1NXB5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vstm4T1NXB5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vstm4T1NXB5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vstm4T1NXB5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vstm4T1NXB5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vstm4T1NXB5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vstm4T1NXB5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vstm4T1NXB5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vstm4T1NXB5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vstm4T1NXB5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vstm4T1NXB5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vstm4T1NXB5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vstm4T1NXB5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vstm4T1NXB5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vstm4T1NXB5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vstm4T1NXB5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vstm4T1NXB5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vstm4T1NXB5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Vstm4T1NXB5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vstm4T1NXB5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vstm4T1NXB5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vstm4T1NXB5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vstm4T1NXB5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vstm4T1NXB5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vstm4T1NXB5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vstm4T1NXB5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Vstm4T1NXB5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vstm4T1NXB5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms