Protein–RNA interactions for Protein: S4R2P9

Slc8a3, Sodium/calcium exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a3S4R2P9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc8a3S4R2P9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc8a3S4R2P9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc8a3S4R2P9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc8a3S4R2P9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc8a3S4R2P9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc8a3S4R2P9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc8a3S4R2P9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc8a3S4R2P9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc8a3S4R2P9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc8a3S4R2P9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc8a3S4R2P9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc8a3S4R2P9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc8a3S4R2P9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc8a3S4R2P9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc8a3S4R2P9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc8a3S4R2P9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc8a3S4R2P9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc8a3S4R2P9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc8a3S4R2P9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc8a3S4R2P9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc8a3S4R2P9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc8a3S4R2P9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc8a3S4R2P9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc8a3S4R2P9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc8a3S4R2P9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc8a3S4R2P9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc8a3S4R2P9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc8a3S4R2P9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc8a3S4R2P9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc8a3S4R2P9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc8a3S4R2P9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc8a3S4R2P9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc8a3S4R2P9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc8a3S4R2P9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc8a3S4R2P9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc8a3S4R2P9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc8a3S4R2P9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc8a3S4R2P9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc8a3S4R2P9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc8a3S4R2P9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc8a3S4R2P9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc8a3S4R2P9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc8a3S4R2P9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc8a3S4R2P9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc8a3S4R2P9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc8a3S4R2P9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc8a3S4R2P9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc8a3S4R2P9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc8a3S4R2P9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slc8a3S4R2P9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc8a3S4R2P9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc8a3S4R2P9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc8a3S4R2P9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc8a3S4R2P9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc8a3S4R2P9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc8a3S4R2P9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc8a3S4R2P9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc8a3S4R2P9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc8a3S4R2P9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc8a3S4R2P9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc8a3S4R2P9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc8a3S4R2P9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc8a3S4R2P9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc8a3S4R2P9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc8a3S4R2P9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc8a3S4R2P9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc8a3S4R2P9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc8a3S4R2P9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc8a3S4R2P9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc8a3S4R2P9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc8a3S4R2P9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc8a3S4R2P9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc8a3S4R2P9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc8a3S4R2P9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc8a3S4R2P9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc8a3S4R2P9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc8a3S4R2P9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc8a3S4R2P9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc8a3S4R2P9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc8a3S4R2P9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc8a3S4R2P9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc8a3S4R2P9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc8a3S4R2P9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc8a3S4R2P9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc8a3S4R2P9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc8a3S4R2P9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc8a3S4R2P9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc8a3S4R2P9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slc8a3S4R2P9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc8a3S4R2P9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc8a3S4R2P9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc8a3S4R2P9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc8a3S4R2P9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc8a3S4R2P9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc8a3S4R2P9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc8a3S4R2P9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc8a3S4R2P9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc8a3S4R2P9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc8a3S4R2P9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms