Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccne2Q9Z238 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccne2Q9Z238 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccne2Q9Z238 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccne2Q9Z238 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccne2Q9Z238 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccne2Q9Z238 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccne2Q9Z238 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccne2Q9Z238 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccne2Q9Z238 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccne2Q9Z238 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccne2Q9Z238 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccne2Q9Z238 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccne2Q9Z238 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccne2Q9Z238 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccne2Q9Z238 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccne2Q9Z238 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccne2Q9Z238 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccne2Q9Z238 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccne2Q9Z238 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccne2Q9Z238 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccne2Q9Z238 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccne2Q9Z238 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Ccne2Q9Z238 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccne2Q9Z238 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccne2Q9Z238 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccne2Q9Z238 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccne2Q9Z238 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccne2Q9Z238 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccne2Q9Z238 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccne2Q9Z238 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccne2Q9Z238 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccne2Q9Z238 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccne2Q9Z238 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccne2Q9Z238 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccne2Q9Z238 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccne2Q9Z238 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccne2Q9Z238 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccne2Q9Z238 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccne2Q9Z238 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccne2Q9Z238 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccne2Q9Z238 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccne2Q9Z238 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccne2Q9Z238 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccne2Q9Z238 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccne2Q9Z238 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccne2Q9Z238 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccne2Q9Z238 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccne2Q9Z238 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccne2Q9Z238 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccne2Q9Z238 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccne2Q9Z238 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccne2Q9Z238 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccne2Q9Z238 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccne2Q9Z238 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccne2Q9Z238 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccne2Q9Z238 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccne2Q9Z238 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccne2Q9Z238 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccne2Q9Z238 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccne2Q9Z238 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccne2Q9Z238 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccne2Q9Z238 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccne2Q9Z238 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccne2Q9Z238 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccne2Q9Z238 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccne2Q9Z238 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccne2Q9Z238 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccne2Q9Z238 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccne2Q9Z238 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccne2Q9Z238 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccne2Q9Z238 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccne2Q9Z238 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccne2Q9Z238 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ccne2Q9Z238 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ccne2Q9Z238 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccne2Q9Z238 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccne2Q9Z238 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccne2Q9Z238 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccne2Q9Z238 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccne2Q9Z238 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccne2Q9Z238 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccne2Q9Z238 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccne2Q9Z238 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccne2Q9Z238 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccne2Q9Z238 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccne2Q9Z238 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccne2Q9Z238 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccne2Q9Z238 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccne2Q9Z238 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccne2Q9Z238 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccne2Q9Z238 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccne2Q9Z238 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccne2Q9Z238 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccne2Q9Z238 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccne2Q9Z238 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccne2Q9Z238 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccne2Q9Z238 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccne2Q9Z238 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccne2Q9Z238 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms