Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RfxankQ9Z205 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RfxankQ9Z205 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RfxankQ9Z205 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RfxankQ9Z205 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RfxankQ9Z205 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RfxankQ9Z205 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RfxankQ9Z205 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RfxankQ9Z205 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RfxankQ9Z205 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RfxankQ9Z205 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RfxankQ9Z205 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RfxankQ9Z205 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RfxankQ9Z205 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RfxankQ9Z205 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RfxankQ9Z205 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RfxankQ9Z205 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RfxankQ9Z205 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RfxankQ9Z205 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RfxankQ9Z205 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RfxankQ9Z205 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RfxankQ9Z205 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RfxankQ9Z205 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RfxankQ9Z205 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RfxankQ9Z205 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RfxankQ9Z205 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RfxankQ9Z205 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RfxankQ9Z205 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RfxankQ9Z205 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RfxankQ9Z205 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RfxankQ9Z205 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RfxankQ9Z205 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RfxankQ9Z205 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RfxankQ9Z205 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RfxankQ9Z205 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RfxankQ9Z205 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RfxankQ9Z205 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RfxankQ9Z205 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RfxankQ9Z205 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RfxankQ9Z205 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RfxankQ9Z205 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RfxankQ9Z205 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RfxankQ9Z205 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RfxankQ9Z205 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RfxankQ9Z205 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RfxankQ9Z205 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RfxankQ9Z205 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RfxankQ9Z205 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RfxankQ9Z205 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RfxankQ9Z205 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RfxankQ9Z205 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RfxankQ9Z205 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RfxankQ9Z205 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RfxankQ9Z205 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RfxankQ9Z205 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RfxankQ9Z205 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RfxankQ9Z205 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RfxankQ9Z205 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RfxankQ9Z205 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RfxankQ9Z205 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RfxankQ9Z205 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RfxankQ9Z205 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RfxankQ9Z205 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RfxankQ9Z205 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RfxankQ9Z205 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RfxankQ9Z205 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RfxankQ9Z205 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RfxankQ9Z205 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RfxankQ9Z205 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RfxankQ9Z205 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RfxankQ9Z205 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RfxankQ9Z205 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RfxankQ9Z205 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RfxankQ9Z205 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RfxankQ9Z205 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RfxankQ9Z205 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RfxankQ9Z205 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RfxankQ9Z205 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RfxankQ9Z205 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RfxankQ9Z205 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RfxankQ9Z205 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RfxankQ9Z205 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RfxankQ9Z205 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RfxankQ9Z205 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RfxankQ9Z205 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RfxankQ9Z205 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RfxankQ9Z205 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RfxankQ9Z205 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RfxankQ9Z205 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RfxankQ9Z205 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RfxankQ9Z205 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RfxankQ9Z205 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RfxankQ9Z205 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RfxankQ9Z205 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RfxankQ9Z205 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RfxankQ9Z205 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RfxankQ9Z205 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RfxankQ9Z205 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RfxankQ9Z205 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RfxankQ9Z205 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms