Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skp2Q9Z0Z3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skp2Q9Z0Z3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skp2Q9Z0Z3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skp2Q9Z0Z3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skp2Q9Z0Z3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skp2Q9Z0Z3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skp2Q9Z0Z3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skp2Q9Z0Z3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skp2Q9Z0Z3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skp2Q9Z0Z3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skp2Q9Z0Z3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skp2Q9Z0Z3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Skp2Q9Z0Z3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Skp2Q9Z0Z3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Skp2Q9Z0Z3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Skp2Q9Z0Z3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Skp2Q9Z0Z3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Skp2Q9Z0Z3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Skp2Q9Z0Z3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Skp2Q9Z0Z3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Skp2Q9Z0Z3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Skp2Q9Z0Z3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Skp2Q9Z0Z3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Skp2Q9Z0Z3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Skp2Q9Z0Z3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Skp2Q9Z0Z3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Skp2Q9Z0Z3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Skp2Q9Z0Z3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Skp2Q9Z0Z3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Skp2Q9Z0Z3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Skp2Q9Z0Z3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Skp2Q9Z0Z3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Skp2Q9Z0Z3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Skp2Q9Z0Z3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Skp2Q9Z0Z3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Skp2Q9Z0Z3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Skp2Q9Z0Z3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Skp2Q9Z0Z3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Skp2Q9Z0Z3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Skp2Q9Z0Z3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Skp2Q9Z0Z3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Skp2Q9Z0Z3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Skp2Q9Z0Z3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Skp2Q9Z0Z3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Skp2Q9Z0Z3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Skp2Q9Z0Z3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Skp2Q9Z0Z3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Skp2Q9Z0Z3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Skp2Q9Z0Z3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Skp2Q9Z0Z3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Skp2Q9Z0Z3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Skp2Q9Z0Z3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Skp2Q9Z0Z3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Skp2Q9Z0Z3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Skp2Q9Z0Z3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Skp2Q9Z0Z3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Skp2Q9Z0Z3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Skp2Q9Z0Z3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skp2Q9Z0Z3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skp2Q9Z0Z3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skp2Q9Z0Z3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skp2Q9Z0Z3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Skp2Q9Z0Z3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Skp2Q9Z0Z3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Skp2Q9Z0Z3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Skp2Q9Z0Z3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Skp2Q9Z0Z3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Skp2Q9Z0Z3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Skp2Q9Z0Z3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Skp2Q9Z0Z3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Skp2Q9Z0Z3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Skp2Q9Z0Z3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Skp2Q9Z0Z3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Skp2Q9Z0Z3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Skp2Q9Z0Z3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Skp2Q9Z0Z3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Skp2Q9Z0Z3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Skp2Q9Z0Z3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Skp2Q9Z0Z3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Skp2Q9Z0Z3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Skp2Q9Z0Z3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Skp2Q9Z0Z3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Skp2Q9Z0Z3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Skp2Q9Z0Z3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Skp2Q9Z0Z3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Skp2Q9Z0Z3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Skp2Q9Z0Z3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Skp2Q9Z0Z3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Skp2Q9Z0Z3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Skp2Q9Z0Z3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Skp2Q9Z0Z3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Skp2Q9Z0Z3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Skp2Q9Z0Z3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Skp2Q9Z0Z3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Skp2Q9Z0Z3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Skp2Q9Z0Z3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Skp2Q9Z0Z3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms