Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn13Q9Z0S4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn13Q9Z0S4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn13Q9Z0S4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn13Q9Z0S4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn13Q9Z0S4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn13Q9Z0S4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn13Q9Z0S4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn13Q9Z0S4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn13Q9Z0S4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn13Q9Z0S4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cldn13Q9Z0S4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn13Q9Z0S4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn13Q9Z0S4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn13Q9Z0S4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn13Q9Z0S4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn13Q9Z0S4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn13Q9Z0S4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn13Q9Z0S4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn13Q9Z0S4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn13Q9Z0S4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn13Q9Z0S4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn13Q9Z0S4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn13Q9Z0S4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn13Q9Z0S4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn13Q9Z0S4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn13Q9Z0S4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn13Q9Z0S4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn13Q9Z0S4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn13Q9Z0S4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn13Q9Z0S4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn13Q9Z0S4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn13Q9Z0S4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cldn13Q9Z0S4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn13Q9Z0S4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn13Q9Z0S4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn13Q9Z0S4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn13Q9Z0S4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn13Q9Z0S4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn13Q9Z0S4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn13Q9Z0S4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn13Q9Z0S4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn13Q9Z0S4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn13Q9Z0S4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn13Q9Z0S4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn13Q9Z0S4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn13Q9Z0S4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn13Q9Z0S4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn13Q9Z0S4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn13Q9Z0S4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn13Q9Z0S4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn13Q9Z0S4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn13Q9Z0S4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn13Q9Z0S4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn13Q9Z0S4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn13Q9Z0S4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn13Q9Z0S4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn13Q9Z0S4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn13Q9Z0S4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn13Q9Z0S4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn13Q9Z0S4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn13Q9Z0S4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn13Q9Z0S4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn13Q9Z0S4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn13Q9Z0S4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cldn13Q9Z0S4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn13Q9Z0S4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn13Q9Z0S4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn13Q9Z0S4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn13Q9Z0S4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn13Q9Z0S4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn13Q9Z0S4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn13Q9Z0S4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn13Q9Z0S4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn13Q9Z0S4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn13Q9Z0S4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn13Q9Z0S4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn13Q9Z0S4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cldn13Q9Z0S4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn13Q9Z0S4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn13Q9Z0S4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn13Q9Z0S4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn13Q9Z0S4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn13Q9Z0S4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn13Q9Z0S4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn13Q9Z0S4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn13Q9Z0S4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn13Q9Z0S4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn13Q9Z0S4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn13Q9Z0S4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn13Q9Z0S4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn13Q9Z0S4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn13Q9Z0S4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn13Q9Z0S4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn13Q9Z0S4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn13Q9Z0S4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn13Q9Z0S4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn13Q9Z0S4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn13Q9Z0S4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
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