Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cited4Q9WUL8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cited4Q9WUL8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cited4Q9WUL8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cited4Q9WUL8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cited4Q9WUL8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cited4Q9WUL8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cited4Q9WUL8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cited4Q9WUL8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cited4Q9WUL8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cited4Q9WUL8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cited4Q9WUL8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cited4Q9WUL8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cited4Q9WUL8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cited4Q9WUL8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cited4Q9WUL8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cited4Q9WUL8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cited4Q9WUL8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cited4Q9WUL8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cited4Q9WUL8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms