Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcsQ9WU84 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcsQ9WU84 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CcsQ9WU84 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcsQ9WU84 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcsQ9WU84 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcsQ9WU84 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcsQ9WU84 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcsQ9WU84 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcsQ9WU84 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcsQ9WU84 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcsQ9WU84 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcsQ9WU84 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcsQ9WU84 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcsQ9WU84 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcsQ9WU84 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcsQ9WU84 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CcsQ9WU84 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CcsQ9WU84 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CcsQ9WU84 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CcsQ9WU84 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CcsQ9WU84 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CcsQ9WU84 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CcsQ9WU84 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CcsQ9WU84 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CcsQ9WU84 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CcsQ9WU84 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CcsQ9WU84 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CcsQ9WU84 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CcsQ9WU84 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CcsQ9WU84 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CcsQ9WU84 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CcsQ9WU84 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CcsQ9WU84 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CcsQ9WU84 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CcsQ9WU84 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CcsQ9WU84 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CcsQ9WU84 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CcsQ9WU84 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CcsQ9WU84 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CcsQ9WU84 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CcsQ9WU84 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CcsQ9WU84 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CcsQ9WU84 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CcsQ9WU84 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CcsQ9WU84 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CcsQ9WU84 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CcsQ9WU84 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CcsQ9WU84 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CcsQ9WU84 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CcsQ9WU84 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CcsQ9WU84 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CcsQ9WU84 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcsQ9WU84 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcsQ9WU84 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcsQ9WU84 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcsQ9WU84 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcsQ9WU84 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcsQ9WU84 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcsQ9WU84 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcsQ9WU84 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcsQ9WU84 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcsQ9WU84 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcsQ9WU84 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CcsQ9WU84 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcsQ9WU84 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcsQ9WU84 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms