Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU01

Khdrbs2, KH domain-containing, RNA-binding, signal transduction-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdrbs2Q9WU01 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Khdrbs2Q9WU01 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Khdrbs2Q9WU01 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Khdrbs2Q9WU01 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Khdrbs2Q9WU01 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Khdrbs2Q9WU01 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Khdrbs2Q9WU01 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Khdrbs2Q9WU01 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Khdrbs2Q9WU01 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Khdrbs2Q9WU01 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Khdrbs2Q9WU01 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Khdrbs2Q9WU01 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Khdrbs2Q9WU01 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Khdrbs2Q9WU01 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Khdrbs2Q9WU01 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Khdrbs2Q9WU01 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Khdrbs2Q9WU01 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Khdrbs2Q9WU01 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Khdrbs2Q9WU01 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Khdrbs2Q9WU01 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Khdrbs2Q9WU01 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Khdrbs2Q9WU01 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Khdrbs2Q9WU01 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Khdrbs2Q9WU01 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Khdrbs2Q9WU01 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Khdrbs2Q9WU01 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Khdrbs2Q9WU01 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Khdrbs2Q9WU01 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Khdrbs2Q9WU01 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Khdrbs2Q9WU01 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Khdrbs2Q9WU01 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Khdrbs2Q9WU01 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Khdrbs2Q9WU01 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Khdrbs2Q9WU01 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Khdrbs2Q9WU01 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Khdrbs2Q9WU01 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Khdrbs2Q9WU01 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Khdrbs2Q9WU01 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Khdrbs2Q9WU01 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Khdrbs2Q9WU01 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Khdrbs2Q9WU01 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Khdrbs2Q9WU01 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Khdrbs2Q9WU01 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Khdrbs2Q9WU01 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Khdrbs2Q9WU01 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Khdrbs2Q9WU01 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Khdrbs2Q9WU01 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Khdrbs2Q9WU01 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Khdrbs2Q9WU01 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Khdrbs2Q9WU01 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Khdrbs2Q9WU01 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Khdrbs2Q9WU01 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Khdrbs2Q9WU01 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Khdrbs2Q9WU01 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Khdrbs2Q9WU01 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Khdrbs2Q9WU01 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Khdrbs2Q9WU01 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Khdrbs2Q9WU01 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Khdrbs2Q9WU01 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Khdrbs2Q9WU01 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Khdrbs2Q9WU01 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Khdrbs2Q9WU01 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Khdrbs2Q9WU01 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Khdrbs2Q9WU01 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Khdrbs2Q9WU01 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Khdrbs2Q9WU01 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Khdrbs2Q9WU01 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Khdrbs2Q9WU01 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Khdrbs2Q9WU01 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Khdrbs2Q9WU01 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Khdrbs2Q9WU01 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Khdrbs2Q9WU01 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Khdrbs2Q9WU01 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Khdrbs2Q9WU01 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Khdrbs2Q9WU01 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Khdrbs2Q9WU01 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Khdrbs2Q9WU01 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Khdrbs2Q9WU01 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Khdrbs2Q9WU01 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Khdrbs2Q9WU01 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Khdrbs2Q9WU01 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Khdrbs2Q9WU01 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Khdrbs2Q9WU01 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Khdrbs2Q9WU01 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Khdrbs2Q9WU01 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Khdrbs2Q9WU01 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Khdrbs2Q9WU01 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Khdrbs2Q9WU01 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Khdrbs2Q9WU01 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Khdrbs2Q9WU01 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Khdrbs2Q9WU01 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Khdrbs2Q9WU01 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Khdrbs2Q9WU01 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Khdrbs2Q9WU01 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Khdrbs2Q9WU01 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Khdrbs2Q9WU01 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Khdrbs2Q9WU01 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Khdrbs2Q9WU01 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Khdrbs2Q9WU01 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Khdrbs2Q9WU01 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms