Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX6

Cul1, Cullin-1, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul1Q9WTX6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul1Q9WTX6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul1Q9WTX6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul1Q9WTX6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul1Q9WTX6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul1Q9WTX6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul1Q9WTX6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul1Q9WTX6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul1Q9WTX6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul1Q9WTX6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul1Q9WTX6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul1Q9WTX6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul1Q9WTX6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul1Q9WTX6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul1Q9WTX6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul1Q9WTX6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul1Q9WTX6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul1Q9WTX6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul1Q9WTX6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul1Q9WTX6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul1Q9WTX6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul1Q9WTX6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul1Q9WTX6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul1Q9WTX6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cul1Q9WTX6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cul1Q9WTX6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cul1Q9WTX6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cul1Q9WTX6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cul1Q9WTX6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cul1Q9WTX6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cul1Q9WTX6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cul1Q9WTX6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cul1Q9WTX6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cul1Q9WTX6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cul1Q9WTX6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cul1Q9WTX6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul1Q9WTX6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul1Q9WTX6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul1Q9WTX6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul1Q9WTX6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul1Q9WTX6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul1Q9WTX6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul1Q9WTX6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul1Q9WTX6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul1Q9WTX6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul1Q9WTX6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul1Q9WTX6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cul1Q9WTX6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul1Q9WTX6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul1Q9WTX6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cul1Q9WTX6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cul1Q9WTX6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cul1Q9WTX6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cul1Q9WTX6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cul1Q9WTX6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cul1Q9WTX6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cul1Q9WTX6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cul1Q9WTX6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cul1Q9WTX6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cul1Q9WTX6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cul1Q9WTX6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cul1Q9WTX6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cul1Q9WTX6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cul1Q9WTX6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cul1Q9WTX6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cul1Q9WTX6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cul1Q9WTX6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cul1Q9WTX6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cul1Q9WTX6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cul1Q9WTX6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cul1Q9WTX6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cul1Q9WTX6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cul1Q9WTX6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cul1Q9WTX6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cul1Q9WTX6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cul1Q9WTX6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cul1Q9WTX6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cul1Q9WTX6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cul1Q9WTX6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cul1Q9WTX6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cul1Q9WTX6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cul1Q9WTX6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cul1Q9WTX6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cul1Q9WTX6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cul1Q9WTX6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cul1Q9WTX6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cul1Q9WTX6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cul1Q9WTX6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cul1Q9WTX6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cul1Q9WTX6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cul1Q9WTX6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cul1Q9WTX6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul1Q9WTX6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul1Q9WTX6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul1Q9WTX6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul1Q9WTX6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul1Q9WTX6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul1Q9WTX6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul1Q9WTX6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul1Q9WTX6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms