Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTK8

Spo11, Meiotic recombination protein SPO11, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spo11Q9WTK8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spo11Q9WTK8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spo11Q9WTK8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spo11Q9WTK8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spo11Q9WTK8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spo11Q9WTK8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spo11Q9WTK8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spo11Q9WTK8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spo11Q9WTK8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Spo11Q9WTK8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Spo11Q9WTK8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Spo11Q9WTK8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spo11Q9WTK8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spo11Q9WTK8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spo11Q9WTK8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spo11Q9WTK8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spo11Q9WTK8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spo11Q9WTK8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spo11Q9WTK8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spo11Q9WTK8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spo11Q9WTK8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spo11Q9WTK8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spo11Q9WTK8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spo11Q9WTK8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spo11Q9WTK8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spo11Q9WTK8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spo11Q9WTK8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Spo11Q9WTK8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spo11Q9WTK8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spo11Q9WTK8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spo11Q9WTK8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spo11Q9WTK8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spo11Q9WTK8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spo11Q9WTK8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spo11Q9WTK8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spo11Q9WTK8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Spo11Q9WTK8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spo11Q9WTK8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spo11Q9WTK8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spo11Q9WTK8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Spo11Q9WTK8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Spo11Q9WTK8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spo11Q9WTK8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spo11Q9WTK8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spo11Q9WTK8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spo11Q9WTK8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Spo11Q9WTK8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spo11Q9WTK8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spo11Q9WTK8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spo11Q9WTK8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spo11Q9WTK8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spo11Q9WTK8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spo11Q9WTK8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spo11Q9WTK8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spo11Q9WTK8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spo11Q9WTK8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spo11Q9WTK8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spo11Q9WTK8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spo11Q9WTK8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spo11Q9WTK8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spo11Q9WTK8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spo11Q9WTK8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spo11Q9WTK8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spo11Q9WTK8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spo11Q9WTK8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spo11Q9WTK8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spo11Q9WTK8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spo11Q9WTK8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spo11Q9WTK8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spo11Q9WTK8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spo11Q9WTK8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spo11Q9WTK8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spo11Q9WTK8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spo11Q9WTK8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spo11Q9WTK8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spo11Q9WTK8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Spo11Q9WTK8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Spo11Q9WTK8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Spo11Q9WTK8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spo11Q9WTK8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spo11Q9WTK8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spo11Q9WTK8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spo11Q9WTK8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spo11Q9WTK8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spo11Q9WTK8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spo11Q9WTK8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spo11Q9WTK8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spo11Q9WTK8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spo11Q9WTK8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spo11Q9WTK8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spo11Q9WTK8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spo11Q9WTK8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spo11Q9WTK8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spo11Q9WTK8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spo11Q9WTK8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spo11Q9WTK8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spo11Q9WTK8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spo11Q9WTK8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Spo11Q9WTK8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spo11Q9WTK8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.4 ms