Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psmb3Q9R1P1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psmb3Q9R1P1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psmb3Q9R1P1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psmb3Q9R1P1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Psmb3Q9R1P1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psmb3Q9R1P1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psmb3Q9R1P1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psmb3Q9R1P1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb3Q9R1P1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb3Q9R1P1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb3Q9R1P1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb3Q9R1P1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb3Q9R1P1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psmb3Q9R1P1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psmb3Q9R1P1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psmb3Q9R1P1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psmb3Q9R1P1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psmb3Q9R1P1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psmb3Q9R1P1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psmb3Q9R1P1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psmb3Q9R1P1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psmb3Q9R1P1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psmb3Q9R1P1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psmb3Q9R1P1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psmb3Q9R1P1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psmb3Q9R1P1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psmb3Q9R1P1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psmb3Q9R1P1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psmb3Q9R1P1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psmb3Q9R1P1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psmb3Q9R1P1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psmb3Q9R1P1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psmb3Q9R1P1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psmb3Q9R1P1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb3Q9R1P1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb3Q9R1P1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb3Q9R1P1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb3Q9R1P1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb3Q9R1P1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb3Q9R1P1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb3Q9R1P1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Psmb3Q9R1P1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Psmb3Q9R1P1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psmb3Q9R1P1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psmb3Q9R1P1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psmb3Q9R1P1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psmb3Q9R1P1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psmb3Q9R1P1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psmb3Q9R1P1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psmb3Q9R1P1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psmb3Q9R1P1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psmb3Q9R1P1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psmb3Q9R1P1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb3Q9R1P1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb3Q9R1P1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb3Q9R1P1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb3Q9R1P1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb3Q9R1P1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb3Q9R1P1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb3Q9R1P1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb3Q9R1P1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psmb3Q9R1P1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psmb3Q9R1P1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Psmb3Q9R1P1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Psmb3Q9R1P1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Psmb3Q9R1P1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psmb3Q9R1P1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psmb3Q9R1P1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psmb3Q9R1P1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psmb3Q9R1P1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psmb3Q9R1P1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psmb3Q9R1P1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psmb3Q9R1P1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psmb3Q9R1P1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psmb3Q9R1P1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psmb3Q9R1P1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psmb3Q9R1P1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psmb3Q9R1P1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psmb3Q9R1P1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psmb3Q9R1P1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psmb3Q9R1P1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Psmb3Q9R1P1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psmb3Q9R1P1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Psmb3Q9R1P1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Psmb3Q9R1P1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Psmb3Q9R1P1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Psmb3Q9R1P1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Psmb3Q9R1P1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Psmb3Q9R1P1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psmb3Q9R1P1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psmb3Q9R1P1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psmb3Q9R1P1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Psmb3Q9R1P1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Psmb3Q9R1P1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Psmb3Q9R1P1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Psmb3Q9R1P1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Psmb3Q9R1P1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Psmb3Q9R1P1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms