Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M5

Tpk1, Thiamin pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpk1Q9R0M5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpk1Q9R0M5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpk1Q9R0M5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpk1Q9R0M5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpk1Q9R0M5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpk1Q9R0M5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpk1Q9R0M5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpk1Q9R0M5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpk1Q9R0M5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpk1Q9R0M5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpk1Q9R0M5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpk1Q9R0M5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpk1Q9R0M5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpk1Q9R0M5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpk1Q9R0M5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpk1Q9R0M5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpk1Q9R0M5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpk1Q9R0M5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpk1Q9R0M5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpk1Q9R0M5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpk1Q9R0M5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpk1Q9R0M5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpk1Q9R0M5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpk1Q9R0M5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpk1Q9R0M5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpk1Q9R0M5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpk1Q9R0M5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpk1Q9R0M5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpk1Q9R0M5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpk1Q9R0M5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpk1Q9R0M5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpk1Q9R0M5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tpk1Q9R0M5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpk1Q9R0M5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpk1Q9R0M5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tpk1Q9R0M5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpk1Q9R0M5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tpk1Q9R0M5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpk1Q9R0M5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpk1Q9R0M5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpk1Q9R0M5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpk1Q9R0M5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpk1Q9R0M5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpk1Q9R0M5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpk1Q9R0M5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpk1Q9R0M5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpk1Q9R0M5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpk1Q9R0M5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpk1Q9R0M5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpk1Q9R0M5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpk1Q9R0M5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpk1Q9R0M5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpk1Q9R0M5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpk1Q9R0M5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpk1Q9R0M5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpk1Q9R0M5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpk1Q9R0M5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpk1Q9R0M5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpk1Q9R0M5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpk1Q9R0M5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpk1Q9R0M5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpk1Q9R0M5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpk1Q9R0M5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tpk1Q9R0M5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tpk1Q9R0M5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tpk1Q9R0M5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpk1Q9R0M5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpk1Q9R0M5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpk1Q9R0M5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpk1Q9R0M5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpk1Q9R0M5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpk1Q9R0M5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpk1Q9R0M5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpk1Q9R0M5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpk1Q9R0M5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpk1Q9R0M5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpk1Q9R0M5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpk1Q9R0M5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpk1Q9R0M5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpk1Q9R0M5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpk1Q9R0M5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpk1Q9R0M5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpk1Q9R0M5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpk1Q9R0M5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpk1Q9R0M5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpk1Q9R0M5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpk1Q9R0M5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpk1Q9R0M5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpk1Q9R0M5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpk1Q9R0M5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpk1Q9R0M5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpk1Q9R0M5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpk1Q9R0M5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpk1Q9R0M5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpk1Q9R0M5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpk1Q9R0M5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpk1Q9R0M5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpk1Q9R0M5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpk1Q9R0M5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpk1Q9R0M5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms