Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AmfrQ9R049 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
AmfrQ9R049 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
AmfrQ9R049 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AmfrQ9R049 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AmfrQ9R049 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AmfrQ9R049 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AmfrQ9R049 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AmfrQ9R049 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AmfrQ9R049 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AmfrQ9R049 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AmfrQ9R049 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AmfrQ9R049 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AmfrQ9R049 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AmfrQ9R049 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AmfrQ9R049 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AmfrQ9R049 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AmfrQ9R049 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AmfrQ9R049 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AmfrQ9R049 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AmfrQ9R049 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AmfrQ9R049 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AmfrQ9R049 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AmfrQ9R049 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AmfrQ9R049 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AmfrQ9R049 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AmfrQ9R049 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AmfrQ9R049 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AmfrQ9R049 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
AmfrQ9R049 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AmfrQ9R049 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
AmfrQ9R049 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AmfrQ9R049 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AmfrQ9R049 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AmfrQ9R049 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AmfrQ9R049 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
AmfrQ9R049 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AmfrQ9R049 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AmfrQ9R049 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
AmfrQ9R049 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AmfrQ9R049 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AmfrQ9R049 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
AmfrQ9R049 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
AmfrQ9R049 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AmfrQ9R049 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AmfrQ9R049 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AmfrQ9R049 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
AmfrQ9R049 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AmfrQ9R049 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AmfrQ9R049 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AmfrQ9R049 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AmfrQ9R049 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
AmfrQ9R049 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AmfrQ9R049 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
AmfrQ9R049 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AmfrQ9R049 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AmfrQ9R049 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AmfrQ9R049 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AmfrQ9R049 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AmfrQ9R049 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AmfrQ9R049 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AmfrQ9R049 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AmfrQ9R049 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AmfrQ9R049 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AmfrQ9R049 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AmfrQ9R049 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AmfrQ9R049 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AmfrQ9R049 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
AmfrQ9R049 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AmfrQ9R049 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AmfrQ9R049 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AmfrQ9R049 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AmfrQ9R049 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AmfrQ9R049 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
AmfrQ9R049 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AmfrQ9R049 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AmfrQ9R049 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AmfrQ9R049 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AmfrQ9R049 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
AmfrQ9R049 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AmfrQ9R049 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AmfrQ9R049 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AmfrQ9R049 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AmfrQ9R049 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AmfrQ9R049 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AmfrQ9R049 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AmfrQ9R049 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AmfrQ9R049 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AmfrQ9R049 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AmfrQ9R049 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AmfrQ9R049 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AmfrQ9R049 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AmfrQ9R049 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AmfrQ9R049 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AmfrQ9R049 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AmfrQ9R049 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AmfrQ9R049 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AmfrQ9R049 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AmfrQ9R049 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AmfrQ9R049 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms