Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf4Q9QZS2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf4Q9QZS2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf4Q9QZS2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf4Q9QZS2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf4Q9QZS2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf4Q9QZS2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf4Q9QZS2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf4Q9QZS2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf4Q9QZS2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf4Q9QZS2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf4Q9QZS2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf4Q9QZS2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf4Q9QZS2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf4Q9QZS2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rnf4Q9QZS2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf4Q9QZS2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf4Q9QZS2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf4Q9QZS2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf4Q9QZS2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf4Q9QZS2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf4Q9QZS2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf4Q9QZS2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rnf4Q9QZS2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rnf4Q9QZS2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rnf4Q9QZS2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf4Q9QZS2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf4Q9QZS2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf4Q9QZS2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf4Q9QZS2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf4Q9QZS2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf4Q9QZS2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf4Q9QZS2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf4Q9QZS2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf4Q9QZS2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf4Q9QZS2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf4Q9QZS2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf4Q9QZS2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf4Q9QZS2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf4Q9QZS2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf4Q9QZS2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf4Q9QZS2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf4Q9QZS2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf4Q9QZS2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf4Q9QZS2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf4Q9QZS2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf4Q9QZS2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf4Q9QZS2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf4Q9QZS2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf4Q9QZS2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf4Q9QZS2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf4Q9QZS2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf4Q9QZS2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf4Q9QZS2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf4Q9QZS2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf4Q9QZS2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf4Q9QZS2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf4Q9QZS2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf4Q9QZS2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf4Q9QZS2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf4Q9QZS2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf4Q9QZS2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf4Q9QZS2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf4Q9QZS2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf4Q9QZS2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf4Q9QZS2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf4Q9QZS2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf4Q9QZS2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rnf4Q9QZS2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf4Q9QZS2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf4Q9QZS2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf4Q9QZS2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf4Q9QZS2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf4Q9QZS2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf4Q9QZS2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf4Q9QZS2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf4Q9QZS2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf4Q9QZS2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf4Q9QZS2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf4Q9QZS2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf4Q9QZS2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf4Q9QZS2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf4Q9QZS2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf4Q9QZS2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf4Q9QZS2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf4Q9QZS2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf4Q9QZS2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf4Q9QZS2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf4Q9QZS2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf4Q9QZS2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf4Q9QZS2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf4Q9QZS2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf4Q9QZS2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf4Q9QZS2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf4Q9QZS2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf4Q9QZS2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf4Q9QZS2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf4Q9QZS2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf4Q9QZS2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms