Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col4a4Q9QZR9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col4a4Q9QZR9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col4a4Q9QZR9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Col4a4Q9QZR9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col4a4Q9QZR9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col4a4Q9QZR9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Col4a4Q9QZR9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Col4a4Q9QZR9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col4a4Q9QZR9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col4a4Q9QZR9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col4a4Q9QZR9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col4a4Q9QZR9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col4a4Q9QZR9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col4a4Q9QZR9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Col4a4Q9QZR9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col4a4Q9QZR9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col4a4Q9QZR9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col4a4Q9QZR9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col4a4Q9QZR9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col4a4Q9QZR9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col4a4Q9QZR9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col4a4Q9QZR9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col4a4Q9QZR9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col4a4Q9QZR9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col4a4Q9QZR9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a4Q9QZR9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a4Q9QZR9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a4Q9QZR9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col4a4Q9QZR9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col4a4Q9QZR9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col4a4Q9QZR9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col4a4Q9QZR9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col4a4Q9QZR9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col4a4Q9QZR9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col4a4Q9QZR9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col4a4Q9QZR9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col4a4Q9QZR9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col4a4Q9QZR9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col4a4Q9QZR9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col4a4Q9QZR9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col4a4Q9QZR9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col4a4Q9QZR9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col4a4Q9QZR9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col4a4Q9QZR9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col4a4Q9QZR9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col4a4Q9QZR9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Col4a4Q9QZR9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col4a4Q9QZR9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col4a4Q9QZR9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col4a4Q9QZR9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col4a4Q9QZR9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col4a4Q9QZR9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col4a4Q9QZR9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col4a4Q9QZR9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col4a4Q9QZR9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col4a4Q9QZR9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col4a4Q9QZR9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col4a4Q9QZR9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col4a4Q9QZR9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col4a4Q9QZR9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col4a4Q9QZR9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col4a4Q9QZR9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col4a4Q9QZR9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col4a4Q9QZR9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col4a4Q9QZR9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col4a4Q9QZR9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col4a4Q9QZR9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col4a4Q9QZR9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col4a4Q9QZR9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col4a4Q9QZR9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col4a4Q9QZR9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col4a4Q9QZR9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col4a4Q9QZR9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col4a4Q9QZR9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col4a4Q9QZR9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col4a4Q9QZR9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col4a4Q9QZR9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col4a4Q9QZR9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col4a4Q9QZR9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Col4a4Q9QZR9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col4a4Q9QZR9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col4a4Q9QZR9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col4a4Q9QZR9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col4a4Q9QZR9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col4a4Q9QZR9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col4a4Q9QZR9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col4a4Q9QZR9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Col4a4Q9QZR9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Col4a4Q9QZR9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col4a4Q9QZR9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Col4a4Q9QZR9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Col4a4Q9QZR9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col4a4Q9QZR9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col4a4Q9QZR9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a4Q9QZR9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Col4a4Q9QZR9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Col4a4Q9QZR9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Col4a4Q9QZR9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col4a4Q9QZR9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms