Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Tnnt3Q9QZ47 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Tnnt3Q9QZ47 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Tnnt3Q9QZ47 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Tnnt3Q9QZ47 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Tnnt3Q9QZ47 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Tnnt3Q9QZ47 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Tnnt3Q9QZ47 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Tnnt3Q9QZ47 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Tnnt3Q9QZ47 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Tnnt3Q9QZ47 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Tnnt3Q9QZ47 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Tnnt3Q9QZ47 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Tnnt3Q9QZ47 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Tnnt3Q9QZ47 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Tnnt3Q9QZ47 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Tnnt3Q9QZ47 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Tnnt3Q9QZ47 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Tnnt3Q9QZ47 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Tnnt3Q9QZ47 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Tnnt3Q9QZ47 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Tnnt3Q9QZ47 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Tnnt3Q9QZ47 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Tnnt3Q9QZ47 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Tnnt3Q9QZ47 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Tnnt3Q9QZ47 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Tnnt3Q9QZ47 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Tnnt3Q9QZ47 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Tnnt3Q9QZ47 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Tnnt3Q9QZ47 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Tnnt3Q9QZ47 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Tnnt3Q9QZ47 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Tnnt3Q9QZ47 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Tnnt3Q9QZ47 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Tnnt3Q9QZ47 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Tnnt3Q9QZ47 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Tnnt3Q9QZ47 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Tnnt3Q9QZ47 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Tnnt3Q9QZ47 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Tnnt3Q9QZ47 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Tnnt3Q9QZ47 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Tnnt3Q9QZ47 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Tnnt3Q9QZ47 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Tnnt3Q9QZ47 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Tnnt3Q9QZ47 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Tnnt3Q9QZ47 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Tnnt3Q9QZ47 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Tnnt3Q9QZ47 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Tnnt3Q9QZ47 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Tnnt3Q9QZ47 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Tnnt3Q9QZ47 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Tnnt3Q9QZ47 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Tnnt3Q9QZ47 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Tnnt3Q9QZ47 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Tnnt3Q9QZ47 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Tnnt3Q9QZ47 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Tnnt3Q9QZ47 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Tnnt3Q9QZ47 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Tnnt3Q9QZ47 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Tnnt3Q9QZ47 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Tnnt3Q9QZ47 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Tnnt3Q9QZ47 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Tnnt3Q9QZ47 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Tnnt3Q9QZ47 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Tnnt3Q9QZ47 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Tnnt3Q9QZ47 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Tnnt3Q9QZ47 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Tnnt3Q9QZ47 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Tnnt3Q9QZ47 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Tnnt3Q9QZ47 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Tnnt3Q9QZ47 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Tnnt3Q9QZ47 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Tnnt3Q9QZ47 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Tnnt3Q9QZ47 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Tnnt3Q9QZ47 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Tnnt3Q9QZ47 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Tnnt3Q9QZ47 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Tnnt3Q9QZ47 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Tnnt3Q9QZ47 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Tnnt3Q9QZ47 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.69
Tnnt3Q9QZ47 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Tnnt3Q9QZ47 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Tnnt3Q9QZ47 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Tnnt3Q9QZ47 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Tnnt3Q9QZ47 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Tnnt3Q9QZ47 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Tnnt3Q9QZ47 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Tnnt3Q9QZ47 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Tnnt3Q9QZ47 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Tnnt3Q9QZ47 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Tnnt3Q9QZ47 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Tnnt3Q9QZ47 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Tnnt3Q9QZ47 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Tnnt3Q9QZ47 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Tnnt3Q9QZ47 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Tnnt3Q9QZ47 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Tnnt3Q9QZ47 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Tnnt3Q9QZ47 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms