Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fscn3Q9QXW4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fscn3Q9QXW4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fscn3Q9QXW4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fscn3Q9QXW4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fscn3Q9QXW4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fscn3Q9QXW4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fscn3Q9QXW4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fscn3Q9QXW4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fscn3Q9QXW4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fscn3Q9QXW4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fscn3Q9QXW4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fscn3Q9QXW4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fscn3Q9QXW4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fscn3Q9QXW4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fscn3Q9QXW4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fscn3Q9QXW4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fscn3Q9QXW4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fscn3Q9QXW4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fscn3Q9QXW4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fscn3Q9QXW4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fscn3Q9QXW4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fscn3Q9QXW4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fscn3Q9QXW4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fscn3Q9QXW4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fscn3Q9QXW4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fscn3Q9QXW4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fscn3Q9QXW4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fscn3Q9QXW4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fscn3Q9QXW4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fscn3Q9QXW4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fscn3Q9QXW4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fscn3Q9QXW4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fscn3Q9QXW4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fscn3Q9QXW4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fscn3Q9QXW4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fscn3Q9QXW4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fscn3Q9QXW4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fscn3Q9QXW4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fscn3Q9QXW4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fscn3Q9QXW4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fscn3Q9QXW4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fscn3Q9QXW4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fscn3Q9QXW4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fscn3Q9QXW4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fscn3Q9QXW4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fscn3Q9QXW4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fscn3Q9QXW4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fscn3Q9QXW4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fscn3Q9QXW4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fscn3Q9QXW4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fscn3Q9QXW4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fscn3Q9QXW4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Fscn3Q9QXW4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fscn3Q9QXW4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fscn3Q9QXW4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fscn3Q9QXW4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fscn3Q9QXW4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fscn3Q9QXW4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fscn3Q9QXW4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fscn3Q9QXW4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fscn3Q9QXW4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fscn3Q9QXW4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fscn3Q9QXW4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fscn3Q9QXW4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fscn3Q9QXW4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fscn3Q9QXW4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fscn3Q9QXW4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fscn3Q9QXW4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fscn3Q9QXW4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fscn3Q9QXW4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fscn3Q9QXW4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fscn3Q9QXW4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fscn3Q9QXW4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fscn3Q9QXW4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fscn3Q9QXW4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fscn3Q9QXW4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fscn3Q9QXW4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fscn3Q9QXW4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fscn3Q9QXW4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Fscn3Q9QXW4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fscn3Q9QXW4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fscn3Q9QXW4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fscn3Q9QXW4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fscn3Q9QXW4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fscn3Q9QXW4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fscn3Q9QXW4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fscn3Q9QXW4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fscn3Q9QXW4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fscn3Q9QXW4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fscn3Q9QXW4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fscn3Q9QXW4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fscn3Q9QXW4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fscn3Q9QXW4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fscn3Q9QXW4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fscn3Q9QXW4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fscn3Q9QXW4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Fscn3Q9QXW4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fscn3Q9QXW4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fscn3Q9QXW4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms