Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXS8

Cml5, Probable N-acetyltransferase CML5, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml5Q9QXS8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cml5Q9QXS8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cml5Q9QXS8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cml5Q9QXS8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cml5Q9QXS8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cml5Q9QXS8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cml5Q9QXS8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cml5Q9QXS8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cml5Q9QXS8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cml5Q9QXS8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cml5Q9QXS8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cml5Q9QXS8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cml5Q9QXS8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cml5Q9QXS8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cml5Q9QXS8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cml5Q9QXS8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cml5Q9QXS8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cml5Q9QXS8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cml5Q9QXS8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cml5Q9QXS8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cml5Q9QXS8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cml5Q9QXS8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cml5Q9QXS8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cml5Q9QXS8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cml5Q9QXS8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cml5Q9QXS8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cml5Q9QXS8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cml5Q9QXS8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cml5Q9QXS8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cml5Q9QXS8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cml5Q9QXS8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cml5Q9QXS8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cml5Q9QXS8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cml5Q9QXS8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cml5Q9QXS8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cml5Q9QXS8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cml5Q9QXS8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cml5Q9QXS8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cml5Q9QXS8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cml5Q9QXS8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cml5Q9QXS8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cml5Q9QXS8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cml5Q9QXS8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cml5Q9QXS8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cml5Q9QXS8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cml5Q9QXS8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cml5Q9QXS8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cml5Q9QXS8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cml5Q9QXS8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cml5Q9QXS8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cml5Q9QXS8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cml5Q9QXS8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cml5Q9QXS8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cml5Q9QXS8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cml5Q9QXS8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cml5Q9QXS8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cml5Q9QXS8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cml5Q9QXS8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cml5Q9QXS8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cml5Q9QXS8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cml5Q9QXS8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cml5Q9QXS8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cml5Q9QXS8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cml5Q9QXS8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cml5Q9QXS8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cml5Q9QXS8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cml5Q9QXS8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cml5Q9QXS8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cml5Q9QXS8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cml5Q9QXS8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cml5Q9QXS8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cml5Q9QXS8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cml5Q9QXS8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cml5Q9QXS8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cml5Q9QXS8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cml5Q9QXS8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cml5Q9QXS8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cml5Q9QXS8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cml5Q9QXS8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cml5Q9QXS8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cml5Q9QXS8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cml5Q9QXS8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cml5Q9QXS8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cml5Q9QXS8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cml5Q9QXS8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cml5Q9QXS8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cml5Q9QXS8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cml5Q9QXS8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cml5Q9QXS8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cml5Q9QXS8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cml5Q9QXS8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cml5Q9QXS8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cml5Q9QXS8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cml5Q9QXS8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cml5Q9QXS8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cml5Q9QXS8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cml5Q9QXS8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cml5Q9QXS8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cml5Q9QXS8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cml5Q9QXS8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms