Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cyth1Q9QX11 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cyth1Q9QX11 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyth1Q9QX11 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyth1Q9QX11 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyth1Q9QX11 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyth1Q9QX11 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyth1Q9QX11 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyth1Q9QX11 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyth1Q9QX11 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyth1Q9QX11 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyth1Q9QX11 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyth1Q9QX11 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyth1Q9QX11 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyth1Q9QX11 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyth1Q9QX11 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyth1Q9QX11 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyth1Q9QX11 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyth1Q9QX11 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyth1Q9QX11 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyth1Q9QX11 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyth1Q9QX11 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyth1Q9QX11 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyth1Q9QX11 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyth1Q9QX11 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyth1Q9QX11 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyth1Q9QX11 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyth1Q9QX11 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyth1Q9QX11 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyth1Q9QX11 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyth1Q9QX11 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyth1Q9QX11 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cyth1Q9QX11 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyth1Q9QX11 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyth1Q9QX11 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyth1Q9QX11 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyth1Q9QX11 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyth1Q9QX11 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyth1Q9QX11 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyth1Q9QX11 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyth1Q9QX11 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyth1Q9QX11 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyth1Q9QX11 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyth1Q9QX11 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyth1Q9QX11 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyth1Q9QX11 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyth1Q9QX11 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyth1Q9QX11 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyth1Q9QX11 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyth1Q9QX11 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyth1Q9QX11 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyth1Q9QX11 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyth1Q9QX11 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyth1Q9QX11 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyth1Q9QX11 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyth1Q9QX11 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyth1Q9QX11 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyth1Q9QX11 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyth1Q9QX11 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyth1Q9QX11 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyth1Q9QX11 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyth1Q9QX11 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyth1Q9QX11 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyth1Q9QX11 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyth1Q9QX11 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyth1Q9QX11 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyth1Q9QX11 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyth1Q9QX11 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyth1Q9QX11 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyth1Q9QX11 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyth1Q9QX11 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyth1Q9QX11 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyth1Q9QX11 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyth1Q9QX11 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyth1Q9QX11 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyth1Q9QX11 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyth1Q9QX11 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyth1Q9QX11 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyth1Q9QX11 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyth1Q9QX11 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyth1Q9QX11 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyth1Q9QX11 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyth1Q9QX11 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyth1Q9QX11 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyth1Q9QX11 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyth1Q9QX11 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyth1Q9QX11 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyth1Q9QX11 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyth1Q9QX11 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyth1Q9QX11 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyth1Q9QX11 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyth1Q9QX11 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyth1Q9QX11 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyth1Q9QX11 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyth1Q9QX11 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyth1Q9QX11 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyth1Q9QX11 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyth1Q9QX11 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyth1Q9QX11 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyth1Q9QX11 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms