Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chaf1aQ9QWF0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chaf1aQ9QWF0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chaf1aQ9QWF0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chaf1aQ9QWF0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chaf1aQ9QWF0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chaf1aQ9QWF0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chaf1aQ9QWF0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chaf1aQ9QWF0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chaf1aQ9QWF0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chaf1aQ9QWF0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chaf1aQ9QWF0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chaf1aQ9QWF0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chaf1aQ9QWF0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chaf1aQ9QWF0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Chaf1aQ9QWF0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chaf1aQ9QWF0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chaf1aQ9QWF0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chaf1aQ9QWF0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chaf1aQ9QWF0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chaf1aQ9QWF0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chaf1aQ9QWF0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chaf1aQ9QWF0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chaf1aQ9QWF0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chaf1aQ9QWF0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chaf1aQ9QWF0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chaf1aQ9QWF0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chaf1aQ9QWF0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chaf1aQ9QWF0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chaf1aQ9QWF0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chaf1aQ9QWF0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chaf1aQ9QWF0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chaf1aQ9QWF0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chaf1aQ9QWF0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chaf1aQ9QWF0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chaf1aQ9QWF0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chaf1aQ9QWF0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chaf1aQ9QWF0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chaf1aQ9QWF0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chaf1aQ9QWF0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chaf1aQ9QWF0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chaf1aQ9QWF0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chaf1aQ9QWF0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chaf1aQ9QWF0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chaf1aQ9QWF0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Chaf1aQ9QWF0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chaf1aQ9QWF0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chaf1aQ9QWF0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chaf1aQ9QWF0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chaf1aQ9QWF0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chaf1aQ9QWF0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chaf1aQ9QWF0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chaf1aQ9QWF0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chaf1aQ9QWF0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Chaf1aQ9QWF0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Chaf1aQ9QWF0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chaf1aQ9QWF0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chaf1aQ9QWF0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Chaf1aQ9QWF0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chaf1aQ9QWF0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chaf1aQ9QWF0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chaf1aQ9QWF0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chaf1aQ9QWF0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chaf1aQ9QWF0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chaf1aQ9QWF0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chaf1aQ9QWF0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chaf1aQ9QWF0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chaf1aQ9QWF0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chaf1aQ9QWF0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chaf1aQ9QWF0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chaf1aQ9QWF0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chaf1aQ9QWF0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chaf1aQ9QWF0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chaf1aQ9QWF0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chaf1aQ9QWF0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chaf1aQ9QWF0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chaf1aQ9QWF0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chaf1aQ9QWF0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Chaf1aQ9QWF0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chaf1aQ9QWF0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chaf1aQ9QWF0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chaf1aQ9QWF0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chaf1aQ9QWF0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chaf1aQ9QWF0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Chaf1aQ9QWF0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chaf1aQ9QWF0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chaf1aQ9QWF0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chaf1aQ9QWF0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chaf1aQ9QWF0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chaf1aQ9QWF0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chaf1aQ9QWF0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chaf1aQ9QWF0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chaf1aQ9QWF0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chaf1aQ9QWF0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chaf1aQ9QWF0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Chaf1aQ9QWF0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Chaf1aQ9QWF0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms