Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dkk3Q9QUN9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dkk3Q9QUN9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dkk3Q9QUN9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dkk3Q9QUN9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dkk3Q9QUN9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dkk3Q9QUN9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dkk3Q9QUN9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dkk3Q9QUN9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dkk3Q9QUN9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dkk3Q9QUN9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dkk3Q9QUN9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dkk3Q9QUN9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Dkk3Q9QUN9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dkk3Q9QUN9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dkk3Q9QUN9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dkk3Q9QUN9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dkk3Q9QUN9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dkk3Q9QUN9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dkk3Q9QUN9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dkk3Q9QUN9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dkk3Q9QUN9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dkk3Q9QUN9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dkk3Q9QUN9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dkk3Q9QUN9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dkk3Q9QUN9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dkk3Q9QUN9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dkk3Q9QUN9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dkk3Q9QUN9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Dkk3Q9QUN9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dkk3Q9QUN9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dkk3Q9QUN9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dkk3Q9QUN9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dkk3Q9QUN9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dkk3Q9QUN9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dkk3Q9QUN9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dkk3Q9QUN9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dkk3Q9QUN9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dkk3Q9QUN9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dkk3Q9QUN9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dkk3Q9QUN9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dkk3Q9QUN9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dkk3Q9QUN9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dkk3Q9QUN9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dkk3Q9QUN9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dkk3Q9QUN9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dkk3Q9QUN9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dkk3Q9QUN9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dkk3Q9QUN9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dkk3Q9QUN9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dkk3Q9QUN9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dkk3Q9QUN9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Dkk3Q9QUN9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dkk3Q9QUN9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dkk3Q9QUN9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dkk3Q9QUN9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dkk3Q9QUN9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dkk3Q9QUN9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dkk3Q9QUN9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dkk3Q9QUN9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dkk3Q9QUN9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dkk3Q9QUN9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dkk3Q9QUN9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dkk3Q9QUN9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dkk3Q9QUN9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dkk3Q9QUN9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dkk3Q9QUN9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dkk3Q9QUN9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dkk3Q9QUN9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dkk3Q9QUN9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dkk3Q9QUN9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dkk3Q9QUN9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Dkk3Q9QUN9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dkk3Q9QUN9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dkk3Q9QUN9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dkk3Q9QUN9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dkk3Q9QUN9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dkk3Q9QUN9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dkk3Q9QUN9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dkk3Q9QUN9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dkk3Q9QUN9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dkk3Q9QUN9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dkk3Q9QUN9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dkk3Q9QUN9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dkk3Q9QUN9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dkk3Q9QUN9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dkk3Q9QUN9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dkk3Q9QUN9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dkk3Q9QUN9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dkk3Q9QUN9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dkk3Q9QUN9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dkk3Q9QUN9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dkk3Q9QUN9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dkk3Q9QUN9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dkk3Q9QUN9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Dkk3Q9QUN9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Dkk3Q9QUN9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dkk3Q9QUN9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dkk3Q9QUN9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Dkk3Q9QUN9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms