Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Msh5Q9QUM7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Msh5Q9QUM7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Msh5Q9QUM7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Msh5Q9QUM7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Msh5Q9QUM7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Msh5Q9QUM7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Msh5Q9QUM7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Msh5Q9QUM7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Msh5Q9QUM7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Msh5Q9QUM7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Msh5Q9QUM7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Msh5Q9QUM7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Msh5Q9QUM7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Msh5Q9QUM7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Msh5Q9QUM7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Msh5Q9QUM7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Msh5Q9QUM7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Msh5Q9QUM7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Msh5Q9QUM7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Msh5Q9QUM7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Msh5Q9QUM7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Msh5Q9QUM7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Msh5Q9QUM7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Msh5Q9QUM7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Msh5Q9QUM7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Msh5Q9QUM7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Msh5Q9QUM7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Msh5Q9QUM7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Msh5Q9QUM7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Msh5Q9QUM7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Msh5Q9QUM7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Msh5Q9QUM7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Msh5Q9QUM7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Msh5Q9QUM7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Msh5Q9QUM7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Msh5Q9QUM7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Msh5Q9QUM7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Msh5Q9QUM7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Msh5Q9QUM7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Msh5Q9QUM7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Msh5Q9QUM7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Msh5Q9QUM7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Msh5Q9QUM7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Msh5Q9QUM7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Msh5Q9QUM7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Msh5Q9QUM7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Msh5Q9QUM7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msh5Q9QUM7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Msh5Q9QUM7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msh5Q9QUM7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msh5Q9QUM7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msh5Q9QUM7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msh5Q9QUM7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msh5Q9QUM7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msh5Q9QUM7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msh5Q9QUM7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msh5Q9QUM7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msh5Q9QUM7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msh5Q9QUM7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msh5Q9QUM7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msh5Q9QUM7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msh5Q9QUM7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msh5Q9QUM7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msh5Q9QUM7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Msh5Q9QUM7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Msh5Q9QUM7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msh5Q9QUM7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msh5Q9QUM7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msh5Q9QUM7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msh5Q9QUM7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msh5Q9QUM7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msh5Q9QUM7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msh5Q9QUM7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Msh5Q9QUM7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msh5Q9QUM7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msh5Q9QUM7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msh5Q9QUM7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msh5Q9QUM7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msh5Q9QUM7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msh5Q9QUM7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msh5Q9QUM7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msh5Q9QUM7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Msh5Q9QUM7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msh5Q9QUM7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msh5Q9QUM7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msh5Q9QUM7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msh5Q9QUM7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msh5Q9QUM7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msh5Q9QUM7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msh5Q9QUM7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msh5Q9QUM7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msh5Q9QUM7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msh5Q9QUM7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msh5Q9QUM7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msh5Q9QUM7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msh5Q9QUM7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msh5Q9QUM7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msh5Q9QUM7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msh5Q9QUM7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms