Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hdgfl3Q9JMG7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hdgfl3Q9JMG7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hdgfl3Q9JMG7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hdgfl3Q9JMG7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hdgfl3Q9JMG7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hdgfl3Q9JMG7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hdgfl3Q9JMG7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hdgfl3Q9JMG7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hdgfl3Q9JMG7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hdgfl3Q9JMG7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hdgfl3Q9JMG7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hdgfl3Q9JMG7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Hdgfl3Q9JMG7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hdgfl3Q9JMG7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hdgfl3Q9JMG7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdgfl3Q9JMG7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdgfl3Q9JMG7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdgfl3Q9JMG7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdgfl3Q9JMG7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl3Q9JMG7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl3Q9JMG7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl3Q9JMG7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl3Q9JMG7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl3Q9JMG7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl3Q9JMG7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl3Q9JMG7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl3Q9JMG7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl3Q9JMG7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hdgfl3Q9JMG7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hdgfl3Q9JMG7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hdgfl3Q9JMG7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hdgfl3Q9JMG7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdgfl3Q9JMG7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdgfl3Q9JMG7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdgfl3Q9JMG7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdgfl3Q9JMG7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdgfl3Q9JMG7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdgfl3Q9JMG7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdgfl3Q9JMG7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdgfl3Q9JMG7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdgfl3Q9JMG7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdgfl3Q9JMG7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdgfl3Q9JMG7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdgfl3Q9JMG7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdgfl3Q9JMG7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdgfl3Q9JMG7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdgfl3Q9JMG7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdgfl3Q9JMG7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdgfl3Q9JMG7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdgfl3Q9JMG7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdgfl3Q9JMG7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdgfl3Q9JMG7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hdgfl3Q9JMG7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hdgfl3Q9JMG7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hdgfl3Q9JMG7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hdgfl3Q9JMG7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hdgfl3Q9JMG7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hdgfl3Q9JMG7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Hdgfl3Q9JMG7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hdgfl3Q9JMG7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Hdgfl3Q9JMG7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hdgfl3Q9JMG7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hdgfl3Q9JMG7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hdgfl3Q9JMG7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hdgfl3Q9JMG7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hdgfl3Q9JMG7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hdgfl3Q9JMG7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hdgfl3Q9JMG7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hdgfl3Q9JMG7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hdgfl3Q9JMG7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hdgfl3Q9JMG7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hdgfl3Q9JMG7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hdgfl3Q9JMG7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Hdgfl3Q9JMG7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hdgfl3Q9JMG7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hdgfl3Q9JMG7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hdgfl3Q9JMG7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hdgfl3Q9JMG7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hdgfl3Q9JMG7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hdgfl3Q9JMG7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hdgfl3Q9JMG7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hdgfl3Q9JMG7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hdgfl3Q9JMG7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hdgfl3Q9JMG7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hdgfl3Q9JMG7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hdgfl3Q9JMG7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hdgfl3Q9JMG7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hdgfl3Q9JMG7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hdgfl3Q9JMG7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hdgfl3Q9JMG7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hdgfl3Q9JMG7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hdgfl3Q9JMG7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hdgfl3Q9JMG7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Hdgfl3Q9JMG7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hdgfl3Q9JMG7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms