Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc2lQ9JME7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc2lQ9JME7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc2lQ9JME7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc2lQ9JME7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc2lQ9JME7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc2lQ9JME7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc2lQ9JME7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc2lQ9JME7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc2lQ9JME7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc2lQ9JME7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc2lQ9JME7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc2lQ9JME7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc2lQ9JME7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc2lQ9JME7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc2lQ9JME7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc2lQ9JME7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc2lQ9JME7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc2lQ9JME7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc2lQ9JME7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc2lQ9JME7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc2lQ9JME7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc2lQ9JME7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc2lQ9JME7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc2lQ9JME7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc2lQ9JME7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc2lQ9JME7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc2lQ9JME7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc2lQ9JME7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc2lQ9JME7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc2lQ9JME7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc2lQ9JME7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc2lQ9JME7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc2lQ9JME7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc2lQ9JME7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc2lQ9JME7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc2lQ9JME7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc2lQ9JME7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc2lQ9JME7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc2lQ9JME7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc2lQ9JME7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc2lQ9JME7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc2lQ9JME7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc2lQ9JME7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc2lQ9JME7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trappc2lQ9JME7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc2lQ9JME7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc2lQ9JME7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc2lQ9JME7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc2lQ9JME7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc2lQ9JME7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc2lQ9JME7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc2lQ9JME7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc2lQ9JME7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc2lQ9JME7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc2lQ9JME7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc2lQ9JME7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc2lQ9JME7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc2lQ9JME7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc2lQ9JME7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc2lQ9JME7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc2lQ9JME7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc2lQ9JME7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc2lQ9JME7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc2lQ9JME7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc2lQ9JME7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc2lQ9JME7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc2lQ9JME7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc2lQ9JME7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc2lQ9JME7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc2lQ9JME7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc2lQ9JME7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc2lQ9JME7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc2lQ9JME7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc2lQ9JME7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc2lQ9JME7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc2lQ9JME7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc2lQ9JME7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc2lQ9JME7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc2lQ9JME7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc2lQ9JME7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc2lQ9JME7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc2lQ9JME7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc2lQ9JME7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc2lQ9JME7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc2lQ9JME7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc2lQ9JME7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc2lQ9JME7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc2lQ9JME7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc2lQ9JME7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc2lQ9JME7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc2lQ9JME7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc2lQ9JME7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc2lQ9JME7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc2lQ9JME7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc2lQ9JME7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc2lQ9JME7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc2lQ9JME7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms