Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gkap1Q9JMB0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gkap1Q9JMB0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gkap1Q9JMB0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gkap1Q9JMB0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gkap1Q9JMB0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gkap1Q9JMB0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gkap1Q9JMB0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Gkap1Q9JMB0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gkap1Q9JMB0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gkap1Q9JMB0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gkap1Q9JMB0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gkap1Q9JMB0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gkap1Q9JMB0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gkap1Q9JMB0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gkap1Q9JMB0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gkap1Q9JMB0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gkap1Q9JMB0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gkap1Q9JMB0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gkap1Q9JMB0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gkap1Q9JMB0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gkap1Q9JMB0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gkap1Q9JMB0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gkap1Q9JMB0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gkap1Q9JMB0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gkap1Q9JMB0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gkap1Q9JMB0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gkap1Q9JMB0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms