Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CtsmQ9JL96 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CtsmQ9JL96 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CtsmQ9JL96 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CtsmQ9JL96 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CtsmQ9JL96 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CtsmQ9JL96 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CtsmQ9JL96 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CtsmQ9JL96 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CtsmQ9JL96 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CtsmQ9JL96 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CtsmQ9JL96 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CtsmQ9JL96 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CtsmQ9JL96 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CtsmQ9JL96 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CtsmQ9JL96 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CtsmQ9JL96 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CtsmQ9JL96 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CtsmQ9JL96 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CtsmQ9JL96 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CtsmQ9JL96 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CtsmQ9JL96 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CtsmQ9JL96 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CtsmQ9JL96 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CtsmQ9JL96 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CtsmQ9JL96 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CtsmQ9JL96 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CtsmQ9JL96 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CtsmQ9JL96 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CtsmQ9JL96 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CtsmQ9JL96 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CtsmQ9JL96 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CtsmQ9JL96 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CtsmQ9JL96 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CtsmQ9JL96 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CtsmQ9JL96 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CtsmQ9JL96 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CtsmQ9JL96 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CtsmQ9JL96 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CtsmQ9JL96 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CtsmQ9JL96 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CtsmQ9JL96 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CtsmQ9JL96 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CtsmQ9JL96 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CtsmQ9JL96 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CtsmQ9JL96 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CtsmQ9JL96 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CtsmQ9JL96 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CtsmQ9JL96 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CtsmQ9JL96 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CtsmQ9JL96 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CtsmQ9JL96 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CtsmQ9JL96 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CtsmQ9JL96 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CtsmQ9JL96 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CtsmQ9JL96 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CtsmQ9JL96 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CtsmQ9JL96 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CtsmQ9JL96 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CtsmQ9JL96 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CtsmQ9JL96 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CtsmQ9JL96 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CtsmQ9JL96 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CtsmQ9JL96 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CtsmQ9JL96 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CtsmQ9JL96 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CtsmQ9JL96 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CtsmQ9JL96 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CtsmQ9JL96 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CtsmQ9JL96 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CtsmQ9JL96 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CtsmQ9JL96 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CtsmQ9JL96 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CtsmQ9JL96 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CtsmQ9JL96 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CtsmQ9JL96 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CtsmQ9JL96 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CtsmQ9JL96 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtsmQ9JL96 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtsmQ9JL96 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtsmQ9JL96 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CtsmQ9JL96 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CtsmQ9JL96 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CtsmQ9JL96 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CtsmQ9JL96 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CtsmQ9JL96 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CtsmQ9JL96 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CtsmQ9JL96 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CtsmQ9JL96 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CtsmQ9JL96 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CtsmQ9JL96 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CtsmQ9JL96 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CtsmQ9JL96 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CtsmQ9JL96 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CtsmQ9JL96 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CtsmQ9JL96 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CtsmQ9JL96 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CtsmQ9JL96 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CtsmQ9JL96 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CtsmQ9JL96 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms