Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rfx5Q9JL61 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rfx5Q9JL61 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rfx5Q9JL61 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rfx5Q9JL61 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rfx5Q9JL61 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rfx5Q9JL61 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rfx5Q9JL61 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rfx5Q9JL61 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rfx5Q9JL61 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rfx5Q9JL61 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rfx5Q9JL61 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rfx5Q9JL61 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rfx5Q9JL61 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rfx5Q9JL61 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rfx5Q9JL61 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rfx5Q9JL61 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rfx5Q9JL61 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rfx5Q9JL61 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rfx5Q9JL61 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rfx5Q9JL61 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rfx5Q9JL61 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rfx5Q9JL61 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rfx5Q9JL61 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rfx5Q9JL61 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rfx5Q9JL61 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rfx5Q9JL61 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rfx5Q9JL61 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rfx5Q9JL61 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rfx5Q9JL61 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rfx5Q9JL61 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rfx5Q9JL61 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rfx5Q9JL61 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rfx5Q9JL61 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rfx5Q9JL61 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rfx5Q9JL61 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rfx5Q9JL61 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rfx5Q9JL61 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.01■■□□□ 1.76
Rfx5Q9JL61 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rfx5Q9JL61 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rfx5Q9JL61 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rfx5Q9JL61 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rfx5Q9JL61 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfx5Q9JL61 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfx5Q9JL61 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfx5Q9JL61 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfx5Q9JL61 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rfx5Q9JL61 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rfx5Q9JL61 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rfx5Q9JL61 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rfx5Q9JL61 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Rfx5Q9JL61 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rfx5Q9JL61 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rfx5Q9JL61 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rfx5Q9JL61 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rfx5Q9JL61 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rfx5Q9JL61 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rfx5Q9JL61 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rfx5Q9JL61 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rfx5Q9JL61 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rfx5Q9JL61 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rfx5Q9JL61 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rfx5Q9JL61 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rfx5Q9JL61 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rfx5Q9JL61 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rfx5Q9JL61 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rfx5Q9JL61 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rfx5Q9JL61 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rfx5Q9JL61 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rfx5Q9JL61 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rfx5Q9JL61 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rfx5Q9JL61 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rfx5Q9JL61 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Rfx5Q9JL61 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Rfx5Q9JL61 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rfx5Q9JL61 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rfx5Q9JL61 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rfx5Q9JL61 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rfx5Q9JL61 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rfx5Q9JL61 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rfx5Q9JL61 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rfx5Q9JL61 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rfx5Q9JL61 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rfx5Q9JL61 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rfx5Q9JL61 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rfx5Q9JL61 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rfx5Q9JL61 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rfx5Q9JL61 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rfx5Q9JL61 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rfx5Q9JL61 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rfx5Q9JL61 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rfx5Q9JL61 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rfx5Q9JL61 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rfx5Q9JL61 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rfx5Q9JL61 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rfx5Q9JL61 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rfx5Q9JL61 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rfx5Q9JL61 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rfx5Q9JL61 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rfx5Q9JL61 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms