Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ap3m1Q9JKC8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ap3m1Q9JKC8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ap3m1Q9JKC8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ap3m1Q9JKC8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ap3m1Q9JKC8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap3m1Q9JKC8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap3m1Q9JKC8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap3m1Q9JKC8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap3m1Q9JKC8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ap3m1Q9JKC8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ap3m1Q9JKC8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ap3m1Q9JKC8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ap3m1Q9JKC8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ap3m1Q9JKC8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ap3m1Q9JKC8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ap3m1Q9JKC8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap3m1Q9JKC8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ap3m1Q9JKC8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ap3m1Q9JKC8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ap3m1Q9JKC8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ap3m1Q9JKC8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ap3m1Q9JKC8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ap3m1Q9JKC8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ap3m1Q9JKC8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ap3m1Q9JKC8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ap3m1Q9JKC8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ap3m1Q9JKC8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ap3m1Q9JKC8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ap3m1Q9JKC8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ap3m1Q9JKC8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ap3m1Q9JKC8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ap3m1Q9JKC8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ap3m1Q9JKC8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap3m1Q9JKC8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap3m1Q9JKC8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ap3m1Q9JKC8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ap3m1Q9JKC8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap3m1Q9JKC8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap3m1Q9JKC8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap3m1Q9JKC8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap3m1Q9JKC8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3m1Q9JKC8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3m1Q9JKC8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3m1Q9JKC8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3m1Q9JKC8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap3m1Q9JKC8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap3m1Q9JKC8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap3m1Q9JKC8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap3m1Q9JKC8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3m1Q9JKC8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3m1Q9JKC8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap3m1Q9JKC8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap3m1Q9JKC8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap3m1Q9JKC8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap3m1Q9JKC8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3m1Q9JKC8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3m1Q9JKC8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3m1Q9JKC8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3m1Q9JKC8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3m1Q9JKC8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3m1Q9JKC8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3m1Q9JKC8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3m1Q9JKC8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3m1Q9JKC8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3m1Q9JKC8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3m1Q9JKC8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3m1Q9JKC8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3m1Q9JKC8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3m1Q9JKC8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3m1Q9JKC8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3m1Q9JKC8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3m1Q9JKC8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3m1Q9JKC8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3m1Q9JKC8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3m1Q9JKC8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3m1Q9JKC8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ap3m1Q9JKC8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ap3m1Q9JKC8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3m1Q9JKC8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3m1Q9JKC8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3m1Q9JKC8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3m1Q9JKC8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3m1Q9JKC8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3m1Q9JKC8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3m1Q9JKC8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap3m1Q9JKC8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap3m1Q9JKC8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap3m1Q9JKC8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ap3m1Q9JKC8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ap3m1Q9JKC8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ap3m1Q9JKC8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ap3m1Q9JKC8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap3m1Q9JKC8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3m1Q9JKC8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3m1Q9JKC8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3m1Q9JKC8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3m1Q9JKC8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap3m1Q9JKC8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap3m1Q9JKC8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7 ms