Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV4

Cacng4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng4Q9JJV4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cacng4Q9JJV4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cacng4Q9JJV4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cacng4Q9JJV4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cacng4Q9JJV4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cacng4Q9JJV4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cacng4Q9JJV4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacng4Q9JJV4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacng4Q9JJV4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cacng4Q9JJV4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cacng4Q9JJV4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cacng4Q9JJV4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cacng4Q9JJV4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cacng4Q9JJV4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cacng4Q9JJV4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cacng4Q9JJV4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cacng4Q9JJV4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacng4Q9JJV4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacng4Q9JJV4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cacng4Q9JJV4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cacng4Q9JJV4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cacng4Q9JJV4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cacng4Q9JJV4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cacng4Q9JJV4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cacng4Q9JJV4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cacng4Q9JJV4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cacng4Q9JJV4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cacng4Q9JJV4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cacng4Q9JJV4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cacng4Q9JJV4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cacng4Q9JJV4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cacng4Q9JJV4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cacng4Q9JJV4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacng4Q9JJV4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacng4Q9JJV4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacng4Q9JJV4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cacng4Q9JJV4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cacng4Q9JJV4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cacng4Q9JJV4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Cacng4Q9JJV4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cacng4Q9JJV4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cacng4Q9JJV4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cacng4Q9JJV4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cacng4Q9JJV4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cacng4Q9JJV4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacng4Q9JJV4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacng4Q9JJV4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cacng4Q9JJV4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cacng4Q9JJV4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cacng4Q9JJV4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cacng4Q9JJV4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cacng4Q9JJV4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cacng4Q9JJV4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cacng4Q9JJV4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cacng4Q9JJV4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cacng4Q9JJV4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cacng4Q9JJV4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cacng4Q9JJV4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cacng4Q9JJV4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cacng4Q9JJV4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacng4Q9JJV4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacng4Q9JJV4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacng4Q9JJV4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cacng4Q9JJV4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cacng4Q9JJV4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cacng4Q9JJV4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cacng4Q9JJV4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cacng4Q9JJV4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cacng4Q9JJV4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cacng4Q9JJV4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cacng4Q9JJV4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cacng4Q9JJV4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cacng4Q9JJV4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cacng4Q9JJV4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cacng4Q9JJV4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cacng4Q9JJV4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cacng4Q9JJV4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cacng4Q9JJV4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacng4Q9JJV4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacng4Q9JJV4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacng4Q9JJV4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacng4Q9JJV4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacng4Q9JJV4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacng4Q9JJV4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacng4Q9JJV4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cacng4Q9JJV4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cacng4Q9JJV4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cacng4Q9JJV4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cacng4Q9JJV4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cacng4Q9JJV4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacng4Q9JJV4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacng4Q9JJV4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacng4Q9JJV4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacng4Q9JJV4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacng4Q9JJV4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacng4Q9JJV4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacng4Q9JJV4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacng4Q9JJV4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cacng4Q9JJV4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cacng4Q9JJV4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms