Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG8

Praf2, PRA1 family protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Praf2Q9JIG8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Praf2Q9JIG8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Praf2Q9JIG8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Praf2Q9JIG8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Praf2Q9JIG8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Praf2Q9JIG8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Praf2Q9JIG8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Praf2Q9JIG8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Praf2Q9JIG8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Praf2Q9JIG8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Praf2Q9JIG8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Praf2Q9JIG8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Praf2Q9JIG8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Praf2Q9JIG8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Praf2Q9JIG8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Praf2Q9JIG8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Praf2Q9JIG8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Praf2Q9JIG8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Praf2Q9JIG8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Praf2Q9JIG8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Praf2Q9JIG8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Praf2Q9JIG8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Praf2Q9JIG8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Praf2Q9JIG8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Praf2Q9JIG8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Praf2Q9JIG8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Praf2Q9JIG8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Praf2Q9JIG8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Praf2Q9JIG8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Praf2Q9JIG8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Praf2Q9JIG8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Praf2Q9JIG8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Praf2Q9JIG8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Praf2Q9JIG8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Praf2Q9JIG8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Praf2Q9JIG8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Praf2Q9JIG8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Praf2Q9JIG8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Praf2Q9JIG8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Praf2Q9JIG8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Praf2Q9JIG8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Praf2Q9JIG8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Praf2Q9JIG8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Praf2Q9JIG8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Praf2Q9JIG8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Praf2Q9JIG8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Praf2Q9JIG8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Praf2Q9JIG8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Praf2Q9JIG8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Praf2Q9JIG8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Praf2Q9JIG8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Praf2Q9JIG8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Praf2Q9JIG8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Praf2Q9JIG8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Praf2Q9JIG8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Praf2Q9JIG8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Praf2Q9JIG8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Praf2Q9JIG8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Praf2Q9JIG8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Praf2Q9JIG8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Praf2Q9JIG8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Praf2Q9JIG8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Praf2Q9JIG8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Praf2Q9JIG8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Praf2Q9JIG8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Praf2Q9JIG8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Praf2Q9JIG8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Praf2Q9JIG8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Praf2Q9JIG8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Praf2Q9JIG8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Praf2Q9JIG8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Praf2Q9JIG8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Praf2Q9JIG8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Praf2Q9JIG8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Praf2Q9JIG8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Praf2Q9JIG8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Praf2Q9JIG8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Praf2Q9JIG8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Praf2Q9JIG8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Praf2Q9JIG8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Praf2Q9JIG8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Praf2Q9JIG8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Praf2Q9JIG8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Praf2Q9JIG8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Praf2Q9JIG8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Praf2Q9JIG8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Praf2Q9JIG8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Praf2Q9JIG8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Praf2Q9JIG8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Praf2Q9JIG8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Praf2Q9JIG8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Praf2Q9JIG8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Praf2Q9JIG8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Praf2Q9JIG8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Praf2Q9JIG8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Praf2Q9JIG8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Praf2Q9JIG8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Praf2Q9JIG8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Praf2Q9JIG8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Praf2Q9JIG8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms