Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI08

Bin3, Bridging integrator 3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bin3Q9JI08 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bin3Q9JI08 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bin3Q9JI08 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bin3Q9JI08 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bin3Q9JI08 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bin3Q9JI08 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bin3Q9JI08 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bin3Q9JI08 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bin3Q9JI08 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bin3Q9JI08 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bin3Q9JI08 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bin3Q9JI08 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bin3Q9JI08 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bin3Q9JI08 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bin3Q9JI08 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bin3Q9JI08 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bin3Q9JI08 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bin3Q9JI08 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bin3Q9JI08 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bin3Q9JI08 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bin3Q9JI08 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bin3Q9JI08 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bin3Q9JI08 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bin3Q9JI08 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bin3Q9JI08 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bin3Q9JI08 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bin3Q9JI08 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bin3Q9JI08 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bin3Q9JI08 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bin3Q9JI08 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bin3Q9JI08 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bin3Q9JI08 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bin3Q9JI08 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bin3Q9JI08 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bin3Q9JI08 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bin3Q9JI08 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bin3Q9JI08 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bin3Q9JI08 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bin3Q9JI08 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bin3Q9JI08 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bin3Q9JI08 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bin3Q9JI08 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bin3Q9JI08 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bin3Q9JI08 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bin3Q9JI08 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bin3Q9JI08 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bin3Q9JI08 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Bin3Q9JI08 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Bin3Q9JI08 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Bin3Q9JI08 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bin3Q9JI08 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bin3Q9JI08 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bin3Q9JI08 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bin3Q9JI08 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bin3Q9JI08 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bin3Q9JI08 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bin3Q9JI08 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bin3Q9JI08 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bin3Q9JI08 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bin3Q9JI08 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bin3Q9JI08 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bin3Q9JI08 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Bin3Q9JI08 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bin3Q9JI08 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bin3Q9JI08 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bin3Q9JI08 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bin3Q9JI08 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bin3Q9JI08 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bin3Q9JI08 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bin3Q9JI08 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bin3Q9JI08 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bin3Q9JI08 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bin3Q9JI08 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bin3Q9JI08 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bin3Q9JI08 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bin3Q9JI08 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bin3Q9JI08 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bin3Q9JI08 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bin3Q9JI08 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bin3Q9JI08 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bin3Q9JI08 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bin3Q9JI08 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bin3Q9JI08 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bin3Q9JI08 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bin3Q9JI08 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bin3Q9JI08 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bin3Q9JI08 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bin3Q9JI08 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bin3Q9JI08 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bin3Q9JI08 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bin3Q9JI08 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bin3Q9JI08 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bin3Q9JI08 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bin3Q9JI08 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bin3Q9JI08 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bin3Q9JI08 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bin3Q9JI08 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bin3Q9JI08 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bin3Q9JI08 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bin3Q9JI08 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms