Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHR9

Nrip2, Nuclear receptor-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip2Q9JHR9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nrip2Q9JHR9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nrip2Q9JHR9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nrip2Q9JHR9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nrip2Q9JHR9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nrip2Q9JHR9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nrip2Q9JHR9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nrip2Q9JHR9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nrip2Q9JHR9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nrip2Q9JHR9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nrip2Q9JHR9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nrip2Q9JHR9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nrip2Q9JHR9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nrip2Q9JHR9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nrip2Q9JHR9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nrip2Q9JHR9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nrip2Q9JHR9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nrip2Q9JHR9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nrip2Q9JHR9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nrip2Q9JHR9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nrip2Q9JHR9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nrip2Q9JHR9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nrip2Q9JHR9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nrip2Q9JHR9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrip2Q9JHR9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrip2Q9JHR9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nrip2Q9JHR9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nrip2Q9JHR9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nrip2Q9JHR9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nrip2Q9JHR9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nrip2Q9JHR9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrip2Q9JHR9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrip2Q9JHR9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrip2Q9JHR9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrip2Q9JHR9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrip2Q9JHR9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nrip2Q9JHR9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nrip2Q9JHR9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nrip2Q9JHR9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nrip2Q9JHR9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrip2Q9JHR9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrip2Q9JHR9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrip2Q9JHR9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrip2Q9JHR9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrip2Q9JHR9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrip2Q9JHR9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrip2Q9JHR9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrip2Q9JHR9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrip2Q9JHR9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrip2Q9JHR9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrip2Q9JHR9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrip2Q9JHR9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrip2Q9JHR9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrip2Q9JHR9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nrip2Q9JHR9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nrip2Q9JHR9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nrip2Q9JHR9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nrip2Q9JHR9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nrip2Q9JHR9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nrip2Q9JHR9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nrip2Q9JHR9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nrip2Q9JHR9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nrip2Q9JHR9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nrip2Q9JHR9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nrip2Q9JHR9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nrip2Q9JHR9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nrip2Q9JHR9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nrip2Q9JHR9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nrip2Q9JHR9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nrip2Q9JHR9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nrip2Q9JHR9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nrip2Q9JHR9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nrip2Q9JHR9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nrip2Q9JHR9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nrip2Q9JHR9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nrip2Q9JHR9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nrip2Q9JHR9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nrip2Q9JHR9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nrip2Q9JHR9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nrip2Q9JHR9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nrip2Q9JHR9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nrip2Q9JHR9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nrip2Q9JHR9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nrip2Q9JHR9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nrip2Q9JHR9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nrip2Q9JHR9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nrip2Q9JHR9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrip2Q9JHR9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrip2Q9JHR9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrip2Q9JHR9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nrip2Q9JHR9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrip2Q9JHR9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrip2Q9JHR9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrip2Q9JHR9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrip2Q9JHR9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrip2Q9JHR9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nrip2Q9JHR9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nrip2Q9JHR9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nrip2Q9JHR9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrip2Q9JHR9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms