Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ush1cQ9ES64 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ush1cQ9ES64 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ush1cQ9ES64 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ush1cQ9ES64 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ush1cQ9ES64 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ush1cQ9ES64 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ush1cQ9ES64 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ush1cQ9ES64 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ush1cQ9ES64 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ush1cQ9ES64 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ush1cQ9ES64 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ush1cQ9ES64 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ush1cQ9ES64 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ush1cQ9ES64 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ush1cQ9ES64 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ush1cQ9ES64 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ush1cQ9ES64 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ush1cQ9ES64 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ush1cQ9ES64 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ush1cQ9ES64 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ush1cQ9ES64 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ush1cQ9ES64 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ush1cQ9ES64 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ush1cQ9ES64 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ush1cQ9ES64 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ush1cQ9ES64 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ush1cQ9ES64 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ush1cQ9ES64 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ush1cQ9ES64 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ush1cQ9ES64 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ush1cQ9ES64 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ush1cQ9ES64 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ush1cQ9ES64 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ush1cQ9ES64 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ush1cQ9ES64 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ush1cQ9ES64 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ush1cQ9ES64 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ush1cQ9ES64 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ush1cQ9ES64 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ush1cQ9ES64 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ush1cQ9ES64 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ush1cQ9ES64 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ush1cQ9ES64 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ush1cQ9ES64 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ush1cQ9ES64 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ush1cQ9ES64 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ush1cQ9ES64 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ush1cQ9ES64 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ush1cQ9ES64 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ush1cQ9ES64 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ush1cQ9ES64 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ush1cQ9ES64 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ush1cQ9ES64 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ush1cQ9ES64 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ush1cQ9ES64 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ush1cQ9ES64 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ush1cQ9ES64 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ush1cQ9ES64 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ush1cQ9ES64 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ush1cQ9ES64 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ush1cQ9ES64 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ush1cQ9ES64 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ush1cQ9ES64 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ush1cQ9ES64 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ush1cQ9ES64 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ush1cQ9ES64 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ush1cQ9ES64 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ush1cQ9ES64 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ush1cQ9ES64 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ush1cQ9ES64 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ush1cQ9ES64 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ush1cQ9ES64 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ush1cQ9ES64 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ush1cQ9ES64 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ush1cQ9ES64 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ush1cQ9ES64 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ush1cQ9ES64 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ush1cQ9ES64 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ush1cQ9ES64 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ush1cQ9ES64 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ush1cQ9ES64 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ush1cQ9ES64 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ush1cQ9ES64 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ush1cQ9ES64 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ush1cQ9ES64 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ush1cQ9ES64 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ush1cQ9ES64 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ush1cQ9ES64 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ush1cQ9ES64 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ush1cQ9ES64 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ush1cQ9ES64 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ush1cQ9ES64 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ush1cQ9ES64 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ush1cQ9ES64 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ush1cQ9ES64 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ush1cQ9ES64 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ush1cQ9ES64 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ush1cQ9ES64 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ush1cQ9ES64 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms