Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES30

C1qtnf3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf3Q9ES30 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1qtnf3Q9ES30 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C1qtnf3Q9ES30 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1qtnf3Q9ES30 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1qtnf3Q9ES30 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1qtnf3Q9ES30 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C1qtnf3Q9ES30 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C1qtnf3Q9ES30 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C1qtnf3Q9ES30 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1qtnf3Q9ES30 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1qtnf3Q9ES30 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1qtnf3Q9ES30 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1qtnf3Q9ES30 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1qtnf3Q9ES30 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1qtnf3Q9ES30 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1qtnf3Q9ES30 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1qtnf3Q9ES30 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1qtnf3Q9ES30 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1qtnf3Q9ES30 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1qtnf3Q9ES30 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1qtnf3Q9ES30 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1qtnf3Q9ES30 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1qtnf3Q9ES30 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1qtnf3Q9ES30 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1qtnf3Q9ES30 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1qtnf3Q9ES30 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1qtnf3Q9ES30 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1qtnf3Q9ES30 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1qtnf3Q9ES30 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1qtnf3Q9ES30 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1qtnf3Q9ES30 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1qtnf3Q9ES30 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1qtnf3Q9ES30 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1qtnf3Q9ES30 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1qtnf3Q9ES30 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1qtnf3Q9ES30 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1qtnf3Q9ES30 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1qtnf3Q9ES30 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1qtnf3Q9ES30 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1qtnf3Q9ES30 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1qtnf3Q9ES30 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1qtnf3Q9ES30 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C1qtnf3Q9ES30 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C1qtnf3Q9ES30 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1qtnf3Q9ES30 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C1qtnf3Q9ES30 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1qtnf3Q9ES30 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1qtnf3Q9ES30 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1qtnf3Q9ES30 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1qtnf3Q9ES30 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1qtnf3Q9ES30 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C1qtnf3Q9ES30 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1qtnf3Q9ES30 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1qtnf3Q9ES30 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1qtnf3Q9ES30 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1qtnf3Q9ES30 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C1qtnf3Q9ES30 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1qtnf3Q9ES30 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1qtnf3Q9ES30 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1qtnf3Q9ES30 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1qtnf3Q9ES30 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1qtnf3Q9ES30 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1qtnf3Q9ES30 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1qtnf3Q9ES30 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1qtnf3Q9ES30 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1qtnf3Q9ES30 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1qtnf3Q9ES30 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1qtnf3Q9ES30 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C1qtnf3Q9ES30 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1qtnf3Q9ES30 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1qtnf3Q9ES30 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1qtnf3Q9ES30 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C1qtnf3Q9ES30 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1qtnf3Q9ES30 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C1qtnf3Q9ES30 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1qtnf3Q9ES30 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1qtnf3Q9ES30 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1qtnf3Q9ES30 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1qtnf3Q9ES30 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1qtnf3Q9ES30 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1qtnf3Q9ES30 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1qtnf3Q9ES30 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C1qtnf3Q9ES30 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1qtnf3Q9ES30 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1qtnf3Q9ES30 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1qtnf3Q9ES30 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1qtnf3Q9ES30 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1qtnf3Q9ES30 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1qtnf3Q9ES30 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1qtnf3Q9ES30 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1qtnf3Q9ES30 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1qtnf3Q9ES30 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1qtnf3Q9ES30 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1qtnf3Q9ES30 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1qtnf3Q9ES30 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1qtnf3Q9ES30 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
C1qtnf3Q9ES30 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1qtnf3Q9ES30 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1qtnf3Q9ES30 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1qtnf3Q9ES30 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms