Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ripk4Q9ERK0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ripk4Q9ERK0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ripk4Q9ERK0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ripk4Q9ERK0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ripk4Q9ERK0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ripk4Q9ERK0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ripk4Q9ERK0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ripk4Q9ERK0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ripk4Q9ERK0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ripk4Q9ERK0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ripk4Q9ERK0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ripk4Q9ERK0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ripk4Q9ERK0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ripk4Q9ERK0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ripk4Q9ERK0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ripk4Q9ERK0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ripk4Q9ERK0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Ripk4Q9ERK0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ripk4Q9ERK0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ripk4Q9ERK0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ripk4Q9ERK0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ripk4Q9ERK0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ripk4Q9ERK0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ripk4Q9ERK0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ripk4Q9ERK0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ripk4Q9ERK0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ripk4Q9ERK0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ripk4Q9ERK0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ripk4Q9ERK0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ripk4Q9ERK0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Ripk4Q9ERK0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ripk4Q9ERK0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ripk4Q9ERK0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ripk4Q9ERK0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ripk4Q9ERK0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ripk4Q9ERK0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ripk4Q9ERK0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ripk4Q9ERK0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ripk4Q9ERK0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ripk4Q9ERK0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ripk4Q9ERK0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ripk4Q9ERK0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ripk4Q9ERK0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Ripk4Q9ERK0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ripk4Q9ERK0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ripk4Q9ERK0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ripk4Q9ERK0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ripk4Q9ERK0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ripk4Q9ERK0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ripk4Q9ERK0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ripk4Q9ERK0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ripk4Q9ERK0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Ripk4Q9ERK0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ripk4Q9ERK0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ripk4Q9ERK0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ripk4Q9ERK0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ripk4Q9ERK0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ripk4Q9ERK0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ripk4Q9ERK0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ripk4Q9ERK0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ripk4Q9ERK0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ripk4Q9ERK0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ripk4Q9ERK0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ripk4Q9ERK0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ripk4Q9ERK0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ripk4Q9ERK0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ripk4Q9ERK0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Ripk4Q9ERK0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ripk4Q9ERK0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ripk4Q9ERK0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ripk4Q9ERK0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ripk4Q9ERK0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ripk4Q9ERK0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ripk4Q9ERK0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ripk4Q9ERK0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ripk4Q9ERK0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ripk4Q9ERK0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ripk4Q9ERK0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ripk4Q9ERK0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ripk4Q9ERK0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ripk4Q9ERK0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ripk4Q9ERK0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ripk4Q9ERK0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ripk4Q9ERK0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ripk4Q9ERK0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ripk4Q9ERK0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ripk4Q9ERK0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ripk4Q9ERK0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ripk4Q9ERK0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ripk4Q9ERK0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ripk4Q9ERK0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ripk4Q9ERK0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ripk4Q9ERK0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Ripk4Q9ERK0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ripk4Q9ERK0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ripk4Q9ERK0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ripk4Q9ERK0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ripk4Q9ERK0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ripk4Q9ERK0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms